RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484163.5

GLT8D1-210, Transcript of glycosyltransferase 8 domain containing 1, human

TSL 5

Gene GLT8D1, Length 1,889 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLT8D1-210	ENST00000484163	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.89	■■■■■ 6.7
GLT8D1-210	ENST00000484163	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		48.99	■■■■■ 5.43
GLT8D1-210	ENST00000484163	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.99	■■■■■ 5.27
GLT8D1-210	ENST00000484163	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.43	■■■■■ 5.18
GLT8D1-210	ENST00000484163	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.93	■■■■■ 5.1
GLT8D1-210	ENST00000484163	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.88	■■■■■ 5.1
GLT8D1-210	ENST00000484163	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	46.15	■■■■■ 4.98
GLT8D1-210	ENST00000484163	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		45.97	■■■■■ 4.95
GLT8D1-210	ENST00000484163	ABCC9	O60706	1549 aa		45.75	■■■■■ 4.91
GLT8D1-210	ENST00000484163	NACAD	O15069	1562 aa		45.5	■■■■■ 4.87
GLT8D1-210	ENST00000484163	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.41	■■■■■ 4.86
GLT8D1-210	ENST00000484163	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		44.93	■■■■■ 4.78
GLT8D1-210	ENST00000484163	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		44.68	■■■■■ 4.74
GLT8D1-210	ENST00000484163	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.61	■■■■■ 4.73
GLT8D1-210	ENST00000484163	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.23	■■■■■ 4.67
GLT8D1-210	ENST00000484163	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		44.07	■■■■■ 4.65
GLT8D1-210	ENST00000484163	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		44.01	■■■■■ 4.64
GLT8D1-210	ENST00000484163	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.81	■■■■■ 4.6
GLT8D1-210	ENST00000484163	WIZ	O95785	1651 aa		43.79	■■■■■ 4.6
GLT8D1-210	ENST00000484163	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.52	■■■■■ 4.56
GLT8D1-210	ENST00000484163	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		43.51	■■■■■ 4.56
GLT8D1-210	ENST00000484163	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	43.39	■■■■■ 4.54
GLT8D1-210	ENST00000484163	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
GLT8D1-210	ENST00000484163	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.23	■■■■■ 4.51
GLT8D1-210	ENST00000484163	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		43.12	■■■■■ 4.49
GLT8D1-210	ENST00000484163	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
GLT8D1-210	ENST00000484163	SMARCA2	P51531	1590 aa		42.94	■■■■■ 4.46
GLT8D1-210	ENST00000484163	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.92	■■■■■ 4.46
GLT8D1-210	ENST00000484163	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.85	■■■■■ 4.45
GLT8D1-210	ENST00000484163	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
GLT8D1-210	ENST00000484163	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		42.54	■■■■■ 4.4
GLT8D1-210	ENST00000484163	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.42	■■■■■ 4.38
GLT8D1-210	ENST00000484163	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
GLT8D1-210	ENST00000484163	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GLT8D1-210	ENST00000484163	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		42.06	■■■■■ 4.32
GLT8D1-210	ENST00000484163	NCAPD3	P42695	1498 aa		42.01	■■■■■ 4.32
GLT8D1-210	ENST00000484163	HMGXB3	Q12766	1538 aa		41.98	■■■■■ 4.31
GLT8D1-210	ENST00000484163	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	41.94	■■■■■ 4.31
GLT8D1-210	ENST00000484163	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	41.92	■■■■■ 4.3
GLT8D1-210	ENST00000484163	HRC	P23327	699 aa		41.91	■■■■■ 4.3
GLT8D1-210	ENST00000484163	SOGA1	O94964	1423 aa		41.85	■■■■■ 4.29
GLT8D1-210	ENST00000484163	EEA1	Q15075	1411 aa		41.84	■■■■■ 4.29
GLT8D1-210	ENST00000484163	SYNJ1	O43426	1573 aa		41.76	■■■■■ 4.28
GLT8D1-210	ENST00000484163	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.66	■■■■■ 4.26
GLT8D1-210	ENST00000484163	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.62	■■■■■ 4.25
GLT8D1-210	ENST00000484163	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		41.47	■■■■■ 4.23
GLT8D1-210	ENST00000484163	TOP2B	Q02880	1626 aa		41.44	■■■■■ 4.22
GLT8D1-210	ENST00000484163	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.38	■■■■■ 4.21
GLT8D1-210	ENST00000484163	CEP162	Q5TB80	1403 aa		41.37	■■■■■ 4.21
GLT8D1-210	ENST00000484163	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.37	■■■■■ 4.21
GLT8D1-210	ENST00000484163	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		41.36	■■■■■ 4.21
GLT8D1-210	ENST00000484163	CFTR	P13569	1480 aa		41.33	■■■■■ 4.21
GLT8D1-210	ENST00000484163	KIF21B	O75037	1637 aa		41.27	■■■■■ 4.2
GLT8D1-210	ENST00000484163	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.26	■■■■■ 4.19
GLT8D1-210	ENST00000484163	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.25	■■■■■ 4.19
GLT8D1-210	ENST00000484163	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.14	■■■■■ 4.18
GLT8D1-210	ENST00000484163	CUX1	P39880	1505 aa		41.12	■■■■■ 4.17
GLT8D1-210	ENST00000484163	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.07	■■■■■ 4.17
GLT8D1-210	ENST00000484163	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.05	■■■■■ 4.16
GLT8D1-210	ENST00000484163	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GLT8D1-210	ENST00000484163	CLIP1	P30622	1438 aa		40.79	■■■■■ 4.12
GLT8D1-210	ENST00000484163	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GLT8D1-210	ENST00000484163	KIF27	Q86VH2	1401 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GLT8D1-210	ENST00000484163	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GLT8D1-210	ENST00000484163	PRX	Q9BXM0	1461 aa		40.76	■■■■■ 4.12
GLT8D1-210	ENST00000484163	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GLT8D1-210	ENST00000484163	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.56	■■■■■ 4.08
GLT8D1-210	ENST00000484163	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
GLT8D1-210	ENST00000484163	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.5	■■■■■ 4.07
GLT8D1-210	ENST00000484163	CUX2	O14529	1486 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GLT8D1-210	ENST00000484163	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GLT8D1-210	ENST00000484163	NES	P48681	1621 aa		40.4	■■■■■ 4.06
GLT8D1-210	ENST00000484163	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
GLT8D1-210	ENST00000484163	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.36	■■■■■ 4.05
GLT8D1-210	ENST00000484163	IGF1R	P08069	1367 aa		40.33	■■■■■ 4.05
GLT8D1-210	ENST00000484163	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.26	■■■■■ 4.04
GLT8D1-210	ENST00000484163	APLP2	Q06481	763 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GLT8D1-210	ENST00000484163	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.25	■■■■■ 4.03
GLT8D1-210	ENST00000484163	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.19	■■■■■ 4.02
GLT8D1-210	ENST00000484163	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		40.17	■■■■■ 4.02
GLT8D1-210	ENST00000484163	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.15	■■■■■ 4.02
GLT8D1-210	ENST00000484163	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.13	■■■■■ 4.01
GLT8D1-210	ENST00000484163	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.13	■■■■■ 4.01
GLT8D1-210	ENST00000484163	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.12	■■■■■ 4.01
GLT8D1-210	ENST00000484163	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		40.11	■■■■■ 4.01
GLT8D1-210	ENST00000484163	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.09	■■■■■ 4.01
GLT8D1-210	ENST00000484163	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.04	■■■■■ 4
GLT8D1-210	ENST00000484163	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	40.01	■■■■■ 4
GLT8D1-210	ENST00000484163	WDR97	A6NE52	1622 aa		39.88	■■■■□ 3.97
GLT8D1-210	ENST00000484163	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		39.86	■■■■□ 3.97
GLT8D1-210	ENST00000484163	CUL7	Q14999	1698 aa		39.84	■■■■□ 3.97
GLT8D1-210	ENST00000484163	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	39.77	■■■■□ 3.96
GLT8D1-210	ENST00000484163	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	39.75	■■■■□ 3.95
GLT8D1-210	ENST00000484163	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.7	■■■■□ 3.95
GLT8D1-210	ENST00000484163	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	39.6	■■■■□ 3.93
GLT8D1-210	ENST00000484163	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.59	■■■■□ 3.93
GLT8D1-210	ENST00000484163	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		39.59	■■■■□ 3.93
GLT8D1-210	ENST00000484163	MAP3K1	Q13233	1512 aa		39.59	■■■■□ 3.93
GLT8D1-210	ENST00000484163	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		39.56	■■■■□ 3.92
GLT8D1-210	ENST00000484163	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.54	■■■■□ 3.92

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