RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487642.5

GLT8D1-212, Transcript of glycosyltransferase 8 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene GLT8D1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLT8D1-212ENST00000487642 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.38■■■■■ 5.5
GLT8D1-212ENST00000487642 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.84■■■■■ 4.61
GLT8D1-212ENST00000487642 ABCC9O60706 1549 aa42.71■■■■■ 4.43
GLT8D1-212ENST00000487642 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
GLT8D1-212ENST00000487642 NACADO15069 1562 aa41.16■■■■■ 4.18
GLT8D1-212ENST00000487642 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.15■■■■■ 4.18
GLT8D1-212ENST00000487642 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.03■■■■■ 4.16
GLT8D1-212ENST00000487642 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.99■■■■■ 4.15
GLT8D1-212ENST00000487642 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.88■■■■■ 4.13
GLT8D1-212ENST00000487642 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.32■■■■■ 4.05
GLT8D1-212ENST00000487642 BICRAQ9NZM4 1560 aa40■■■■□ 3.99
GLT8D1-212ENST00000487642 SCRIBQ14160 1630 aa39.98■■■■□ 3.99
GLT8D1-212ENST00000487642 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.91■■■■□ 3.98
GLT8D1-212ENST00000487642 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.51■■■■□ 3.92
GLT8D1-212ENST00000487642 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.13■■■■□ 3.85
GLT8D1-212ENST00000487642 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
GLT8D1-212ENST00000487642 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.67■■■■□ 3.78
GLT8D1-212ENST00000487642 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
GLT8D1-212ENST00000487642 SMARCA4P51532 1647 aa38.29■■■■□ 3.72
GLT8D1-212ENST00000487642 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
GLT8D1-212ENST00000487642 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.07■■■■□ 3.69
GLT8D1-212ENST00000487642 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.03■■■■□ 3.68
GLT8D1-212ENST00000487642 NCAPD3P42695 1498 aa38■■■■□ 3.67
GLT8D1-212ENST00000487642 SMARCA2P51531 1590 aa37.96■■■■□ 3.67
GLT8D1-212ENST00000487642 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.93■■■■□ 3.66
GLT8D1-212ENST00000487642 HMGXB3Q12766 1538 aa37.82■■■■□ 3.64
GLT8D1-212ENST00000487642 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
GLT8D1-212ENST00000487642 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.68■■■■□ 3.62
GLT8D1-212ENST00000487642 WIZO95785 1651 aa37.66■■■■□ 3.62
GLT8D1-212ENST00000487642 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
GLT8D1-212ENST00000487642 NESP48681 1621 aa37.04■■■■□ 3.52
GLT8D1-212ENST00000487642 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.95■■■■□ 3.51
GLT8D1-212ENST00000487642 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.86■■■■□ 3.49
GLT8D1-212ENST00000487642 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.82■■■■□ 3.48
GLT8D1-212ENST00000487642 ERCC6Q03468 1493 aa36.73■■■■□ 3.47
GLT8D1-212ENST00000487642 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
GLT8D1-212ENST00000487642 CFTRP13569 1480 aa36.7■■■■□ 3.47
GLT8D1-212ENST00000487642 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.64■■■■□ 3.46
GLT8D1-212ENST00000487642 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.61■■■■□ 3.45
GLT8D1-212ENST00000487642 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
GLT8D1-212ENST00000487642 PRDM2Q13029 1718 aa36.46■■■■□ 3.43
GLT8D1-212ENST00000487642 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.43■■■■□ 3.42
GLT8D1-212ENST00000487642 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.37■■■■□ 3.41
GLT8D1-212ENST00000487642 CUX2O14529 1486 aa36.35■■■■□ 3.41
GLT8D1-212ENST00000487642 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.3■■■■□ 3.4
GLT8D1-212ENST00000487642 WDR62O43379 1518 aa36.21■■■■□ 3.39
GLT8D1-212ENST00000487642 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
GLT8D1-212ENST00000487642 TOPBP1Q92547 1522 aa35.9■■■■□ 3.34
GLT8D1-212ENST00000487642 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.86■■■■□ 3.33
GLT8D1-212ENST00000487642 ABCC8Q09428 1581 aa35.85■■■■□ 3.33
GLT8D1-212ENST00000487642 CUX1P39880 1505 aa35.71■■■■□ 3.31
GLT8D1-212ENST00000487642 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
GLT8D1-212ENST00000487642 IFT140Q96RY7 1462 aa35.6■■■■□ 3.29
GLT8D1-212ENST00000487642 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
GLT8D1-212ENST00000487642 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.53■■■■□ 3.28
GLT8D1-212ENST00000487642 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.27
GLT8D1-212ENST00000487642 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
GLT8D1-212ENST00000487642 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.44■■■■□ 3.26
GLT8D1-212ENST00000487642 SYNJ1O43426 1573 aa35.44■■■■□ 3.26
GLT8D1-212ENST00000487642 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.44■■■■□ 3.26
GLT8D1-212ENST00000487642 TOP2BQ02880 1626 aa35.43■■■■□ 3.26
GLT8D1-212ENST00000487642 SOGA1O94964 1423 aa35.41■■■■□ 3.26
GLT8D1-212ENST00000487642 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
GLT8D1-212ENST00000487642 WDR97A6NE52 1622 aa35.29■■■■□ 3.24
GLT8D1-212ENST00000487642 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.26■■■■□ 3.23
GLT8D1-212ENST00000487642 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
GLT8D1-212ENST00000487642 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.2■■■■□ 3.23
GLT8D1-212ENST00000487642 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.08■■■■□ 3.21
GLT8D1-212ENST00000487642 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.06■■■■□ 3.2
GLT8D1-212ENST00000487642 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.02■■■■□ 3.2
GLT8D1-212ENST00000487642 GRIN2BQ13224 1484 aa34.99■■■■□ 3.19
GLT8D1-212ENST00000487642 PBRM1Q86U86 1689 aa34.98■■■■□ 3.19
GLT8D1-212ENST00000487642 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.94■■■■□ 3.18
GLT8D1-212ENST00000487642 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
GLT8D1-212ENST00000487642 CHD1O14646 1710 aa34.87■■■■□ 3.17
GLT8D1-212ENST00000487642 OSCARQ8IYS5 282 aa34.82■■■■□ 3.16
GLT8D1-212ENST00000487642 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.77■■■■□ 3.16
GLT8D1-212ENST00000487642 SYNJ2O15056 1496 aa34.76■■■■□ 3.15
GLT8D1-212ENST00000487642 ADAMTS12P58397 1594 aa34.72■■■■□ 3.15
GLT8D1-212ENST00000487642 FBLN2P98095 1184 aa34.7■■■■□ 3.15
GLT8D1-212ENST00000487642 KIF27Q86VH2 1401 aa34.7■■■■□ 3.15
GLT8D1-212ENST00000487642 TRIM41Q8WV44 630 aa34.67■■■■□ 3.14
GLT8D1-212ENST00000487642 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
GLT8D1-212ENST00000487642 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.62■■■■□ 3.13
GLT8D1-212ENST00000487642 IGF1RP08069 1367 aa34.59■■■■□ 3.13
GLT8D1-212ENST00000487642 GRIN2AQ12879 1464 aa34.57■■■■□ 3.12
GLT8D1-212ENST00000487642 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.52■■■■□ 3.12
GLT8D1-212ENST00000487642 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.51■■■■□ 3.12
GLT8D1-212ENST00000487642 CUL7Q14999 1698 aa34.47■■■■□ 3.11
GLT8D1-212ENST00000487642 NUP160Q12769 1436 aa34.43■■■■□ 3.1
GLT8D1-212ENST00000487642 CEP170Q5SW79 1584 aa34.42■■■■□ 3.1
GLT8D1-212ENST00000487642 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.42■■■■□ 3.1
GLT8D1-212ENST00000487642 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.36■■■■□ 3.09
GLT8D1-212ENST00000487642 ARHGEF11O15085 1522 aa34.33■■■■□ 3.09
GLT8D1-212ENST00000487642 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
GLT8D1-212ENST00000487642 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
GLT8D1-212ENST00000487642 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.33■■■■□ 3.09
GLT8D1-212ENST00000487642 SHROOM2Q13796 1616 aa34.18■■■■□ 3.06
GLT8D1-212ENST00000487642 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.17■■■■□ 3.06
GLT8D1-212ENST00000487642 PRXQ9BXM0 1461 aa34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms