Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX3Q13185 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CBX3Q13185 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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