Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AL391244.1-208ENST00000453521 858 ntTSL 217.89■□□□□ 0.453e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.383e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AL391244.1-203ENST00000418833 2196 ntTSL 216.73■□□□□ 0.273e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AL391244.1-202ENST00000444362 1747 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.233e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 EXOSC3-203ENST00000465229 1625 ntTSL 215.97■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.113e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 215.42■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 CDKN2AIP-204ENST00000506835 888 ntTSL 214.9□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AL391244.1-207ENST00000572242 2228 nt14.82□□□□□ -0.043e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 RAP2A-202ENST00000476869 903 ntTSL 313.43□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC11.89□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.693e-12■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 DAB2-202ENST00000339788 3690 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 PACSIN1-206ENST00000538621 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 LSG1-201ENST00000265245 3572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 DAB2-217ENST00000545653 4537 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 DAB2-201ENST00000320816 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 28.84□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 WDR7-213ENST00000615645 5257 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC8.12□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 NNT-AS1-204ENST00000513560 4769 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.51□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 C9-203ENST00000483232 560 ntTSL 45.53□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-7■■■■■ 43
PUM2Q8TB72 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.266e-10■■■■■ 42.9
PUM2Q8TB72 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.196e-10■■■■■ 42.9
PUM2Q8TB72 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 42.9
PUM2Q8TB72 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 42.9
PUM2Q8TB72 SNRK-206ENST00000468628 470 ntTSL 38.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 42.9
PUM2Q8TB72 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-12■■■■■ 42.9
PUM2Q8TB72 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.734e-26■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 SS18L2-203ENST00000474941 567 ntTSL 27.71□□□□□ -1.181e-19■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 327.53■■■□□ 25e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 CLEC3B-203ENST00000490386 708 ntTSL 326.36■■□□□ 1.815e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 213.47□□□□□ -0.255e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 513.45□□□□□ -0.265e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 511.03□□□□□ -0.645e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.655e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-209ENST00000486727 1647 ntTSL 29.92□□□□□ -0.825e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 CCDC25-201ENST00000356537 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 CCDC25-207ENST00000520486 3586 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 EXOSC7-202ENST00000459856 434 ntTSL 37.31□□□□□ -1.245e-23■■■■■ 42.8
PUM2Q8TB72 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.422e-9■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 INTS10-202ENST00000517546 864 ntTSL 213.58□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 INTS10-206ENST00000520670 623 ntTSL 510.53□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 INTS10-216ENST00000523772 777 ntTSL 510.53□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 INTS10-207ENST00000520827 631 ntTSL 37.75□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.81e-9■■■■■ 42.7
PUM2Q8TB72 NHEJ1-203ENST00000418099 2113 ntTSL 514.5□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-203ENST00000540768 1926 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-216ENST00000581104 2233 ntTSL 28.89□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 AC068946.1-201ENST00000498327 4222 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.272e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 ECT2-215ENST00000487073 628 ntTSL 35.95□□□□□ -1.462e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-213ENST00000579838 373 ntTSL 44.45□□□□□ -1.72e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-225ENST00000584155 300 ntTSL 23.59□□□□□ -1.832e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-209ENST00000578987 388 ntTSL 33.42□□□□□ -1.862e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 NUP85-214ENST00000579900 528 ntTSL 53.02□□□□□ -1.932e-8■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.564e-12■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.284e-12■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 GIT1-204ENST00000473217 3462 ntTSL 1 (best)11.2□□□□□ -0.624e-12■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-10■■■■■ 42.6
PUM2Q8TB72 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.393e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-211ENST00000602305 961 ntTSL 522.07■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-215ENST00000602811 1136 ntTSL 522.07■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MTMR1-209ENST00000485376 2973 ntTSL 1 (best)21.89■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 42.4
PUM2Q8TB72 MAP2K4-207ENST00000582183 551 ntTSL 420.64■□□□□ 0.893e-8■■■■■ 42.4
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