RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602811.5

MAP2K4-215, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase 4, human

TSL 5

Gene MAP2K4, Length 1,136 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAP2K4-215	ENST00000602811	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.11	■■■■■ 6.41
MAP2K4-215	ENST00000602811	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.49	■■■■■ 5.51
MAP2K4-215	ENST00000602811	ABCC9	O60706	1549 aa		49.04	■■■■■ 5.44
MAP2K4-215	ENST00000602811	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		46.88	■■■■■ 5.1
MAP2K4-215	ENST00000602811	NACAD	O15069	1562 aa		46.61	■■■■■ 5.05
MAP2K4-215	ENST00000602811	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.18	■■■■■ 4.98
MAP2K4-215	ENST00000602811	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.08	■■■■■ 4.97
MAP2K4-215	ENST00000602811	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		45.99	■■■■■ 4.95
MAP2K4-215	ENST00000602811	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	45.76	■■■■■ 4.92
MAP2K4-215	ENST00000602811	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45.68	■■■■■ 4.9
MAP2K4-215	ENST00000602811	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	45.59	■■■■■ 4.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.58	■■■■■ 4.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.53	■■■■■ 4.88
MAP2K4-215	ENST00000602811	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.01	■■■■■ 4.8
MAP2K4-215	ENST00000602811	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		44.93	■■■■■ 4.78
MAP2K4-215	ENST00000602811	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.39	■■■■■ 4.7
MAP2K4-215	ENST00000602811	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.36	■■■■■ 4.69
MAP2K4-215	ENST00000602811	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.15	■■■■■ 4.66
MAP2K4-215	ENST00000602811	SMARCA4	P51532	1647 aa		43	■■■■■ 4.47
MAP2K4-215	ENST00000602811	NCAPD3	P42695	1498 aa		42.97	■■■■■ 4.47
MAP2K4-215	ENST00000602811	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		42.88	■■■■■ 4.46
MAP2K4-215	ENST00000602811	SMARCA2	P51531	1590 aa		42.82	■■■■■ 4.45
MAP2K4-215	ENST00000602811	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
MAP2K4-215	ENST00000602811	HMGXB3	Q12766	1538 aa		42.76	■■■■■ 4.44
MAP2K4-215	ENST00000602811	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.59	■■■■■ 4.41
MAP2K4-215	ENST00000602811	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.49	■■■■■ 4.39
MAP2K4-215	ENST00000602811	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.47	■■■■■ 4.39
MAP2K4-215	ENST00000602811	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MAP2K4-215	ENST00000602811	NES	P48681	1621 aa		42.22	■■■■■ 4.35
MAP2K4-215	ENST00000602811	CUX2	O14529	1486 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MAP2K4-215	ENST00000602811	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.04	■■■■■ 4.32
MAP2K4-215	ENST00000602811	WIZ	O95785	1651 aa		42.03	■■■■■ 4.32
MAP2K4-215	ENST00000602811	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	41.85	■■■■■ 4.29
MAP2K4-215	ENST00000602811	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		41.83	■■■■■ 4.29
MAP2K4-215	ENST00000602811	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.75	■■■■■ 4.27
MAP2K4-215	ENST00000602811	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		41.68	■■■■■ 4.26
MAP2K4-215	ENST00000602811	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.63	■■■■■ 4.26
MAP2K4-215	ENST00000602811	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	41.63	■■■■■ 4.26
MAP2K4-215	ENST00000602811	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.5	■■■■■ 4.23
MAP2K4-215	ENST00000602811	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
MAP2K4-215	ENST00000602811	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.35	■■■■■ 4.21
MAP2K4-215	ENST00000602811	WDR62	O43379	1518 aa		41.29	■■■■■ 4.2
MAP2K4-215	ENST00000602811	CFTR	P13569	1480 aa		41.27	■■■■■ 4.2
MAP2K4-215	ENST00000602811	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.25	■■■■■ 4.19
MAP2K4-215	ENST00000602811	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.21	■■■■■ 4.19
MAP2K4-215	ENST00000602811	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.13	■■■■■ 4.17
MAP2K4-215	ENST00000602811	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		40.96	■■■■■ 4.15
MAP2K4-215	ENST00000602811	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	40.88	■■■■■ 4.14
MAP2K4-215	ENST00000602811	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.48	■■■■■ 4.07
MAP2K4-215	ENST00000602811	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MAP2K4-215	ENST00000602811	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.4	■■■■■ 4.06
MAP2K4-215	ENST00000602811	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.39	■■■■■ 4.06
MAP2K4-215	ENST00000602811	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.31	■■■■■ 4.04
MAP2K4-215	ENST00000602811	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
MAP2K4-215	ENST00000602811	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.18	■■■■■ 4.02
MAP2K4-215	ENST00000602811	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.17	■■■■■ 4.02
MAP2K4-215	ENST00000602811	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
MAP2K4-215	ENST00000602811	TRIM41	Q8WV44	630 aa		39.99	■■■■□ 3.99
MAP2K4-215	ENST00000602811	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	39.94	■■■■□ 3.98	7e-6	■■□□□ 13.1
MAP2K4-215	ENST00000602811	CHD1	O14646	1710 aa		39.9	■■■■□ 3.98
MAP2K4-215	ENST00000602811	CUX1	P39880	1505 aa		39.9	■■■■□ 3.98
MAP2K4-215	ENST00000602811	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		39.89	■■■■□ 3.98
MAP2K4-215	ENST00000602811	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		39.87	■■■■□ 3.97
MAP2K4-215	ENST00000602811	SOGA1	O94964	1423 aa		39.83	■■■■□ 3.97
MAP2K4-215	ENST00000602811	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.82	■■■■□ 3.96
MAP2K4-215	ENST00000602811	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.82	■■■■□ 3.96
MAP2K4-215	ENST00000602811	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.82	■■■■□ 3.96
MAP2K4-215	ENST00000602811	WDR97	A6NE52	1622 aa		39.8	■■■■□ 3.96
MAP2K4-215	ENST00000602811	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	39.71	■■■■□ 3.95
MAP2K4-215	ENST00000602811	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.67	■■■■□ 3.94
MAP2K4-215	ENST00000602811	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		39.58	■■■■□ 3.93
MAP2K4-215	ENST00000602811	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.54	■■■■□ 3.92
MAP2K4-215	ENST00000602811	FBLN2	P98095	1184 aa		39.52	■■■■□ 3.92
MAP2K4-215	ENST00000602811	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.5	■■■■□ 3.91
MAP2K4-215	ENST00000602811	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.5	■■■■□ 3.91
MAP2K4-215	ENST00000602811	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.44	■■■■□ 3.9
MAP2K4-215	ENST00000602811	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.44	■■■■□ 3.9
MAP2K4-215	ENST00000602811	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.43	■■■■□ 3.9
MAP2K4-215	ENST00000602811	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.4	■■■■□ 3.9
MAP2K4-215	ENST00000602811	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.38	■■■■□ 3.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.36	■■■■□ 3.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		39.36	■■■■□ 3.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.36	■■■■□ 3.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.36	■■■■□ 3.89
MAP2K4-215	ENST00000602811	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.3	■■■■□ 3.88
MAP2K4-215	ENST00000602811	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.29	■■■■□ 3.88
MAP2K4-215	ENST00000602811	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.28	■■■■□ 3.88
MAP2K4-215	ENST00000602811	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.21	■■■■□ 3.87
MAP2K4-215	ENST00000602811	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.1	■■■■□ 3.85
MAP2K4-215	ENST00000602811	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.02	■■■■□ 3.84
MAP2K4-215	ENST00000602811	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		38.97	■■■■□ 3.83
MAP2K4-215	ENST00000602811	CEP170	Q5SW79	1584 aa		38.91	■■■■□ 3.82
MAP2K4-215	ENST00000602811	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		38.9	■■■■□ 3.82
MAP2K4-215	ENST00000602811	NUP160	Q12769	1436 aa		38.88	■■■■□ 3.81
MAP2K4-215	ENST00000602811	SHROOM2	Q13796	1616 aa		38.77	■■■■□ 3.8
MAP2K4-215	ENST00000602811	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		38.75	■■■■□ 3.79
MAP2K4-215	ENST00000602811	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	38.67	■■■■□ 3.78
MAP2K4-215	ENST00000602811	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		38.56	■■■■□ 3.76
MAP2K4-215	ENST00000602811	CUL7	Q14999	1698 aa		38.52	■■■■□ 3.76
MAP2K4-215	ENST00000602811	KIF27	Q86VH2	1401 aa		38.5	■■■■□ 3.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms