RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602305.5

MAP2K4-211, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene MAP2K4, Length 961 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4-211ENST00000602305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.11■■■■■ 6.41
MAP2K4-211ENST00000602305 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.49■■■■■ 5.51
MAP2K4-211ENST00000602305 ABCC9O60706 1549 aa49.04■■■■■ 5.44
MAP2K4-211ENST00000602305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.88■■■■■ 5.1
MAP2K4-211ENST00000602305 NACADO15069 1562 aa46.61■■■■■ 5.05
MAP2K4-211ENST00000602305 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.18■■■■■ 4.98
MAP2K4-211ENST00000602305 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.08■■■■■ 4.97
MAP2K4-211ENST00000602305 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.99■■■■■ 4.95
MAP2K4-211ENST00000602305 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
MAP2K4-211ENST00000602305 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.68■■■■■ 4.9
MAP2K4-211ENST00000602305 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.59■■■■■ 4.89
MAP2K4-211ENST00000602305 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.58■■■■■ 4.89
MAP2K4-211ENST00000602305 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.53■■■■■ 4.88
MAP2K4-211ENST00000602305 SCRIBQ14160 1630 aa45.01■■■■■ 4.8
MAP2K4-211ENST00000602305 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.93■■■■■ 4.78
MAP2K4-211ENST00000602305 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.39■■■■■ 4.7
MAP2K4-211ENST00000602305 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
MAP2K4-211ENST00000602305 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.15■■■■■ 4.66
MAP2K4-211ENST00000602305 SMARCA4P51532 1647 aa43■■■■■ 4.47
MAP2K4-211ENST00000602305 NCAPD3P42695 1498 aa42.97■■■■■ 4.47
MAP2K4-211ENST00000602305 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.88■■■■■ 4.46
MAP2K4-211ENST00000602305 SMARCA2P51531 1590 aa42.82■■■■■ 4.45
MAP2K4-211ENST00000602305 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.78■■■■■ 4.44
MAP2K4-211ENST00000602305 HMGXB3Q12766 1538 aa42.76■■■■■ 4.44
MAP2K4-211ENST00000602305 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.59■■■■■ 4.41
MAP2K4-211ENST00000602305 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
MAP2K4-211ENST00000602305 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.47■■■■■ 4.39
MAP2K4-211ENST00000602305 ERCC6Q03468 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
MAP2K4-211ENST00000602305 NESP48681 1621 aa42.22■■■■■ 4.35
MAP2K4-211ENST00000602305 CUX2O14529 1486 aa42.19■■■■■ 4.34
MAP2K4-211ENST00000602305 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.04■■■■■ 4.32
MAP2K4-211ENST00000602305 WIZO95785 1651 aa42.03■■■■■ 4.32
MAP2K4-211ENST00000602305 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
MAP2K4-211ENST00000602305 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.83■■■■■ 4.29
MAP2K4-211ENST00000602305 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.75■■■■■ 4.27
MAP2K4-211ENST00000602305 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.68■■■■■ 4.26
MAP2K4-211ENST00000602305 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.63■■■■■ 4.26
MAP2K4-211ENST00000602305 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.26
MAP2K4-211ENST00000602305 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
MAP2K4-211ENST00000602305 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
MAP2K4-211ENST00000602305 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.35■■■■■ 4.21
MAP2K4-211ENST00000602305 WDR62O43379 1518 aa41.29■■■■■ 4.2
MAP2K4-211ENST00000602305 CFTRP13569 1480 aa41.27■■■■■ 4.2
MAP2K4-211ENST00000602305 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.25■■■■■ 4.19
MAP2K4-211ENST00000602305 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.21■■■■■ 4.19
MAP2K4-211ENST00000602305 PRDM2Q13029 1718 aa41.13■■■■■ 4.17
MAP2K4-211ENST00000602305 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.96■■■■■ 4.15
MAP2K4-211ENST00000602305 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
MAP2K4-211ENST00000602305 TOPBP1Q92547 1522 aa40.48■■■■■ 4.07
MAP2K4-211ENST00000602305 ABCC8Q09428 1581 aa40.4■■■■■ 4.06
MAP2K4-211ENST00000602305 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.4■■■■■ 4.06
MAP2K4-211ENST00000602305 IFT140Q96RY7 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
MAP2K4-211ENST00000602305 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
MAP2K4-211ENST00000602305 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
MAP2K4-211ENST00000602305 OSCARQ8IYS5 282 aa40.18■■■■■ 4.02
MAP2K4-211ENST00000602305 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
MAP2K4-211ENST00000602305 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
MAP2K4-211ENST00000602305 TRIM41Q8WV44 630 aa39.99■■■■□ 3.99
MAP2K4-211ENST00000602305 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.987e-6■■□□□ 13.1
MAP2K4-211ENST00000602305 CHD1O14646 1710 aa39.9■■■■□ 3.98
MAP2K4-211ENST00000602305 CUX1P39880 1505 aa39.9■■■■□ 3.98
MAP2K4-211ENST00000602305 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.89■■■■□ 3.98
MAP2K4-211ENST00000602305 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.87■■■■□ 3.97
MAP2K4-211ENST00000602305 SOGA1O94964 1423 aa39.83■■■■□ 3.97
MAP2K4-211ENST00000602305 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.82■■■■□ 3.96
MAP2K4-211ENST00000602305 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.82■■■■□ 3.96
MAP2K4-211ENST00000602305 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.82■■■■□ 3.96
MAP2K4-211ENST00000602305 WDR97A6NE52 1622 aa39.8■■■■□ 3.96
MAP2K4-211ENST00000602305 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
MAP2K4-211ENST00000602305 ARHGEF11O15085 1522 aa39.67■■■■□ 3.94
MAP2K4-211ENST00000602305 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.58■■■■□ 3.93
MAP2K4-211ENST00000602305 PBRM1Q86U86 1689 aa39.54■■■■□ 3.92
MAP2K4-211ENST00000602305 FBLN2P98095 1184 aa39.52■■■■□ 3.92
MAP2K4-211ENST00000602305 GRIN2BQ13224 1484 aa39.5■■■■□ 3.91
MAP2K4-211ENST00000602305 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
MAP2K4-211ENST00000602305 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.44■■■■□ 3.9
MAP2K4-211ENST00000602305 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.44■■■■□ 3.9
MAP2K4-211ENST00000602305 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.43■■■■□ 3.9
MAP2K4-211ENST00000602305 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.4■■■■□ 3.9
MAP2K4-211ENST00000602305 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.38■■■■□ 3.89
MAP2K4-211ENST00000602305 TOP2BQ02880 1626 aa39.36■■■■□ 3.89
MAP2K4-211ENST00000602305 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.36■■■■□ 3.89
MAP2K4-211ENST00000602305 SYNJ1O43426 1573 aa39.36■■■■□ 3.89
MAP2K4-211ENST00000602305 SYNJ2O15056 1496 aa39.36■■■■□ 3.89
MAP2K4-211ENST00000602305 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
MAP2K4-211ENST00000602305 ARAP1Q96P48 1450 aa39.29■■■■□ 3.88
MAP2K4-211ENST00000602305 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.28■■■■□ 3.88
MAP2K4-211ENST00000602305 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.21■■■■□ 3.87
MAP2K4-211ENST00000602305 ADAMTS12P58397 1594 aa39.1■■■■□ 3.85
MAP2K4-211ENST00000602305 GRIN2AQ12879 1464 aa39.02■■■■□ 3.84
MAP2K4-211ENST00000602305 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.97■■■■□ 3.83
MAP2K4-211ENST00000602305 CEP170Q5SW79 1584 aa38.91■■■■□ 3.82
MAP2K4-211ENST00000602305 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.9■■■■□ 3.82
MAP2K4-211ENST00000602305 NUP160Q12769 1436 aa38.88■■■■□ 3.81
MAP2K4-211ENST00000602305 SHROOM2Q13796 1616 aa38.77■■■■□ 3.8
MAP2K4-211ENST00000602305 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.75■■■■□ 3.79
MAP2K4-211ENST00000602305 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
MAP2K4-211ENST00000602305 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.56■■■■□ 3.76
MAP2K4-211ENST00000602305 CUL7Q14999 1698 aa38.52■■■■□ 3.76
MAP2K4-211ENST00000602305 KIF27Q86VH2 1401 aa38.5■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.1 ms