Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 RASGRF2-203ENST00000503795 3837 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 67.9
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TBRG4Q969Z0 L3MBTL4-208ENST00000583809 549 ntTSL 422.58■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 67.7
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TBRG4Q969Z0 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 67.7
TBRG4Q969Z0 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 67.7
TBRG4Q969Z0 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 67.7
TBRG4Q969Z0 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 67.7
TBRG4Q969Z0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 67.6
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TBRG4Q969Z0 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 67.6
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TBRG4Q969Z0 PRDM15-205ENST00000441787 6542 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 67.6
TBRG4Q969Z0 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 67.6
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TBRG4Q969Z0 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 67.5
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TBRG4Q969Z0 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 67.5
TBRG4Q969Z0 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 415.45■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 67.5
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TBRG4Q969Z0 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 57.37□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 67.2
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TBRG4Q969Z0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 67.1
TBRG4Q969Z0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.421e-10■■■■■ 67.1
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TBRG4Q969Z0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 67
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TBRG4Q969Z0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 66.7
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TBRG4Q969Z0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.239e-9■■■■■ 66.7
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TBRG4Q969Z0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 MCRIP2-205ENST00000611328 628 ntTSL 315□□□□□ -0.015e-8■■■■■ 66.7
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TBRG4Q969Z0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C14orf159-227ENST00000523576 860 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 DDX49-207ENST00000598972 753 ntTSL 314.35□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 66.7
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TBRG4Q969Z0 CDC14B-207ENST00000463547 553 ntTSL 414.29□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 ATP1B3-204ENST00000466678 1708 ntTSL 313.97□□□□□ -0.171e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 NPHP4-207ENST00000470763 3156 ntTSL 213.71□□□□□ -0.229e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.241e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 TTC28-AS1-204ENST00000424161 556 ntTSL 413.35□□□□□ -0.279e-9■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 ATXN2-207ENST00000475132 610 ntTSL 213.27□□□□□ -0.294e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 ARHGAP17-215ENST00000575283 2213 ntTSL 213.12□□□□□ -0.311e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 TTC28-AS1-202ENST00000417497 627 ntTSL 313□□□□□ -0.339e-9■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.359e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 DDX49-202ENST00000593361 557 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 TTC28-AS1-217ENST00000452612 746 ntTSL 312.54□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.421e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.511e-14■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 DDX49-203ENST00000594021 721 ntTSL 411.58□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 66.7
TBRG4Q969Z0 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-14■■■■■ 66.7
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