RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.82■■■□□ 2.68
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCC9O60706 1549 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.39■■□□□ 1.82
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.34■■□□□ 1.81
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NACADO15069 1562 aa26.31■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.3■■□□□ 1.8
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.21■■□□□ 1.79
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SCRIBQ14160 1630 aa25.63■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.6■■□□□ 1.69
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.39■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.34■■□□□ 1.65
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.7■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SMARCA4P51532 1647 aa24.58■■□□□ 1.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.51■■□□□ 1.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.44■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SMARCA2P51531 1590 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.32■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.3■■□□□ 1.48
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NCAPD3P42695 1498 aa24.26■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WIZO95785 1651 aa24.26■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HMGXB3Q12766 1538 aa24.2■■□□□ 1.47
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.75■■□□□ 1.39
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.56■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CFTRP13569 1480 aa23.54■■□□□ 1.36
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NESP48681 1621 aa23.49■■□□□ 1.35
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRDM2Q13029 1718 aa23.41■■□□□ 1.34
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.3■■□□□ 1.32
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ERCC6Q03468 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.1■■□□□ 1.29
TTC28-AS1-204ENST00000424161 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCC8Q09428 1581 aa23.03■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WDR62O43379 1518 aa23.01■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CUX1P39880 1505 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TOPBP1Q92547 1522 aa22.98■■□□□ 1.27
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TOP2BQ02880 1626 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SYNJ1O43426 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CUX2O14529 1486 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.82■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.79■■□□□ 1.24
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRIM41Q8WV44 630 aa22.75■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IFT140Q96RY7 1462 aa22.73■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SOGA1O94964 1423 aa22.72■■□□□ 1.23
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.67■■□□□ 1.22
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.64■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WDR97A6NE52 1622 aa22.63■■□□□ 1.21
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.5■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF27Q86VH2 1401 aa22.49■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.47■■□□□ 1.19
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GRIN2BQ13224 1484 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EEA1Q15075 1411 aa22.41■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PBRM1Q86U86 1689 aa22.39■■□□□ 1.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.39■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.39■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IGF1RP08069 1367 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.31■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CUL7Q14999 1698 aa22.28■■□□□ 1.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ADAMTS12P58397 1594 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.25■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.24■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SYNJ2O15056 1496 aa22.22■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.21■■□□□ 1.15
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRXQ9BXM0 1461 aa22.19■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GRIN2AQ12879 1464 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF21BO75037 1637 aa22.12■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CHD1O14646 1710 aa22.11■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FBLN2P98095 1184 aa22.09■■□□□ 1.13
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GOLGA3Q08378 1498 aa22.03■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUP160Q12769 1436 aa22.02■■□□□ 1.12
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CEP170Q5SW79 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OSCARQ8IYS5 282 aa21.96■■□□□ 1.11
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.92■■□□□ 1.1
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.91■■□□□ 1.1
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