Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BPTFQ12830 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BPTFQ12830 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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