Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RASGEF1BQ0VAM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms