Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLCB3Q01970 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLCB3Q01970 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLCB3Q01970 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms