RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314349.8

TIMM50-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM50, Length 1,612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-201ENST00000314349 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.71■■■■■ 6.19
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TIMM50-201ENST00000314349 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
TIMM50-201ENST00000314349 NACADO15069 1562 aa44.77■■■■■ 4.76
TIMM50-201ENST00000314349 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.77■■■■■ 4.76
TIMM50-201ENST00000314349 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.68■■■■■ 4.74
TIMM50-201ENST00000314349 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.59■■■■■ 4.73
TIMM50-201ENST00000314349 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.48■■■■■ 4.71
TIMM50-201ENST00000314349 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.73■■■■■ 4.59
TIMM50-201ENST00000314349 SCRIBQ14160 1630 aa43.51■■■■■ 4.56
TIMM50-201ENST00000314349 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.41■■■■■ 4.54
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TIMM50-201ENST00000314349 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.02■■■■■ 4.32
TIMM50-201ENST00000314349 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.81■■■■■ 4.28
TIMM50-201ENST00000314349 SMARCA4P51532 1647 aa41.65■■■■■ 4.26
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TIMM50-201ENST00000314349 SMARCA2P51531 1590 aa41.32■■■■■ 4.21
TIMM50-201ENST00000314349 NCAPD3P42695 1498 aa41.3■■■■■ 4.2
TIMM50-201ENST00000314349 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.25■■■■■ 4.19
TIMM50-201ENST00000314349 HMGXB3Q12766 1538 aa41.16■■■■■ 4.18
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TIMM50-201ENST00000314349 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.19■■■■■ 4.02
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TIMM50-201ENST00000314349 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.65■■■■□ 3.94
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TIMM50-201ENST00000314349 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.59■■■■□ 3.93
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TIMM50-201ENST00000314349 ABCC8Q09428 1581 aa39.04■■■■□ 3.84
TIMM50-201ENST00000314349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.02■■■■□ 3.84
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TIMM50-201ENST00000314349 IFT140Q96RY7 1462 aa38.75■■■■□ 3.79
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TIMM50-201ENST00000314349 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.67■■■■□ 3.78
TIMM50-201ENST00000314349 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.65■■■■□ 3.78
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TIMM50-201ENST00000314349 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.55■■■■□ 3.76
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TIMM50-201ENST00000314349 WDR97A6NE52 1622 aa38.36■■■■□ 3.73
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TIMM50-201ENST00000314349 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.16■■■■□ 3.7
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TIMM50-201ENST00000314349 GRIN2BQ13224 1484 aa38.09■■■■□ 3.69
TIMM50-201ENST00000314349 PBRM1Q86U86 1689 aa38.04■■■■□ 3.68
TIMM50-201ENST00000314349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.02■■■■□ 3.68
TIMM50-201ENST00000314349 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.01■■■■□ 3.67
TIMM50-201ENST00000314349 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
TIMM50-201ENST00000314349 CHD1O14646 1710 aa37.88■■■■□ 3.65
TIMM50-201ENST00000314349 OSCARQ8IYS5 282 aa37.86■■■■□ 3.65
TIMM50-201ENST00000314349 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.86■■■■□ 3.65
TIMM50-201ENST00000314349 SYNJ2O15056 1496 aa37.83■■■■□ 3.65
TIMM50-201ENST00000314349 TRIM41Q8WV44 630 aa37.82■■■■□ 3.64
TIMM50-201ENST00000314349 KIF27Q86VH2 1401 aa37.82■■■■□ 3.64
TIMM50-201ENST00000314349 FBLN2P98095 1184 aa37.79■■■■□ 3.64
TIMM50-201ENST00000314349 ADAMTS12P58397 1594 aa37.78■■■■□ 3.64
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TIMM50-201ENST00000314349 GRIN2AQ12879 1464 aa37.61■■■■□ 3.61
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TIMM50-201ENST00000314349 ARHGEF11O15085 1522 aa37.32■■■■□ 3.56
TIMM50-201ENST00000314349 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
TIMM50-201ENST00000314349 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
TIMM50-201ENST00000314349 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.28■■■■□ 3.56
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TIMM50-201ENST00000314349 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.22■■■■□ 3.55
TIMM50-201ENST00000314349 PRXQ9BXM0 1461 aa37.16■■■■□ 3.54
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