RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375222.3

C20orf144-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 144, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C20orf144, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf144-201ENST00000375222 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.47■■■■■ 6.15
C20orf144-201ENST00000375222 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.64■■■■■ 5.22
C20orf144-201ENST00000375222 ABCC9O60706 1549 aa46.74■■■■■ 5.07
C20orf144-201ENST00000375222 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.94■■■■■ 4.78
C20orf144-201ENST00000375222 NACADO15069 1562 aa44.83■■■■■ 4.77
C20orf144-201ENST00000375222 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.82■■■■■ 4.77
C20orf144-201ENST00000375222 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.5■■■■■ 4.71
C20orf144-201ENST00000375222 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
C20orf144-201ENST00000375222 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.25■■■■■ 4.67
C20orf144-201ENST00000375222 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.87■■■■■ 4.61
C20orf144-201ENST00000375222 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.65■■■■■ 4.58
C20orf144-201ENST00000375222 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.5■■■■■ 4.55
C20orf144-201ENST00000375222 SCRIBQ14160 1630 aa43.42■■■■■ 4.54
C20orf144-201ENST00000375222 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.11■■■■■ 4.49
C20orf144-201ENST00000375222 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.01■■■■■ 4.48
C20orf144-201ENST00000375222 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
C20orf144-201ENST00000375222 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.28■■■■■ 4.36
C20orf144-201ENST00000375222 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.03■■■■■ 4.32
C20orf144-201ENST00000375222 SMARCA4P51532 1647 aa41.53■■■■■ 4.24
C20orf144-201ENST00000375222 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
C20orf144-201ENST00000375222 NCAPD3P42695 1498 aa41.36■■■■■ 4.21
C20orf144-201ENST00000375222 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.34■■■■■ 4.21
C20orf144-201ENST00000375222 SMARCA2P51531 1590 aa41.33■■■■■ 4.21
C20orf144-201ENST00000375222 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.19■■■■■ 4.18
C20orf144-201ENST00000375222 HMGXB3Q12766 1538 aa41.13■■■■■ 4.18
C20orf144-201ENST00000375222 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.12■■■■■ 4.17
C20orf144-201ENST00000375222 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
C20orf144-201ENST00000375222 WIZO95785 1651 aa40.75■■■■■ 4.11
C20orf144-201ENST00000375222 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
C20orf144-201ENST00000375222 NESP48681 1621 aa40.37■■■■■ 4.05
C20orf144-201ENST00000375222 ERCC6Q03468 1493 aa40.34■■■■■ 4.05
C20orf144-201ENST00000375222 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
C20orf144-201ENST00000375222 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.31■■■■■ 4.04
C20orf144-201ENST00000375222 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.16■■■■■ 4.02
C20orf144-201ENST00000375222 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.07■■■■■ 4
C20orf144-201ENST00000375222 CUX2O14529 1486 aa39.96■■■■□ 3.99
C20orf144-201ENST00000375222 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.92■■■■□ 3.98
C20orf144-201ENST00000375222 CFTRP13569 1480 aa39.86■■■■□ 3.97
C20orf144-201ENST00000375222 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.85■■■■□ 3.97
C20orf144-201ENST00000375222 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
C20orf144-201ENST00000375222 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.68■■■■□ 3.94
C20orf144-201ENST00000375222 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.67■■■■□ 3.94
C20orf144-201ENST00000375222 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.63■■■■□ 3.94
C20orf144-201ENST00000375222 PRDM2Q13029 1718 aa39.59■■■■□ 3.93
C20orf144-201ENST00000375222 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
C20orf144-201ENST00000375222 WDR62O43379 1518 aa39.48■■■■□ 3.91
C20orf144-201ENST00000375222 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
C20orf144-201ENST00000375222 ABCC8Q09428 1581 aa39.08■■■■□ 3.85
C20orf144-201ENST00000375222 TOPBP1Q92547 1522 aa39.03■■■■□ 3.84
C20orf144-201ENST00000375222 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.98■■■■□ 3.83
C20orf144-201ENST00000375222 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.93■■■■□ 3.82
C20orf144-201ENST00000375222 IFT140Q96RY7 1462 aa38.85■■■■□ 3.81
C20orf144-201ENST00000375222 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
C20orf144-201ENST00000375222 CUX1P39880 1505 aa38.65■■■■□ 3.78
C20orf144-201ENST00000375222 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
C20orf144-201ENST00000375222 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
C20orf144-201ENST00000375222 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.57■■■■□ 3.76
C20orf144-201ENST00000375222 SOGA1O94964 1423 aa38.55■■■■□ 3.76
C20orf144-201ENST00000375222 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.51■■■■□ 3.76
C20orf144-201ENST00000375222 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
C20orf144-201ENST00000375222 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.42■■■■□ 3.74
C20orf144-201ENST00000375222 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.74
C20orf144-201ENST00000375222 WDR97A6NE52 1622 aa38.34■■■■□ 3.73
C20orf144-201ENST00000375222 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
C20orf144-201ENST00000375222 OSCARQ8IYS5 282 aa38.32■■■■□ 3.72
C20orf144-201ENST00000375222 TOP2BQ02880 1626 aa38.3■■■■□ 3.72
C20orf144-201ENST00000375222 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.3■■■■□ 3.72
C20orf144-201ENST00000375222 SYNJ1O43426 1573 aa38.25■■■■□ 3.71
C20orf144-201ENST00000375222 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.19■■■■□ 3.7
C20orf144-201ENST00000375222 GRIN2BQ13224 1484 aa38.12■■■■□ 3.69
C20orf144-201ENST00000375222 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.09■■■■□ 3.69
C20orf144-201ENST00000375222 FBLN2P98095 1184 aa38.06■■■■□ 3.68
C20orf144-201ENST00000375222 CHD1O14646 1710 aa38.06■■■■□ 3.68
C20orf144-201ENST00000375222 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.05■■■■□ 3.68
C20orf144-201ENST00000375222 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
C20orf144-201ENST00000375222 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.03■■■■□ 3.68
C20orf144-201ENST00000375222 PBRM1Q86U86 1689 aa38.02■■■■□ 3.68
C20orf144-201ENST00000375222 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
C20orf144-201ENST00000375222 SYNJ2O15056 1496 aa37.88■■■■□ 3.65
C20orf144-201ENST00000375222 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.75■■■■□ 3.63
C20orf144-201ENST00000375222 ADAMTS12P58397 1594 aa37.68■■■■□ 3.62
C20orf144-201ENST00000375222 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.66■■■■□ 3.62
C20orf144-201ENST00000375222 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.66■■■■□ 3.62
C20orf144-201ENST00000375222 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.66■■■■□ 3.62
C20orf144-201ENST00000375222 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.66■■■■□ 3.62
C20orf144-201ENST00000375222 ARHGEF11O15085 1522 aa37.63■■■■□ 3.61
C20orf144-201ENST00000375222 KIF27Q86VH2 1401 aa37.61■■■■□ 3.61
C20orf144-201ENST00000375222 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.61■■■■□ 3.61
C20orf144-201ENST00000375222 GRIN2AQ12879 1464 aa37.61■■■■□ 3.61
C20orf144-201ENST00000375222 TRIM41Q8WV44 630 aa37.6■■■■□ 3.61
C20orf144-201ENST00000375222 IGF1RP08069 1367 aa37.45■■■■□ 3.59
C20orf144-201ENST00000375222 NUP160Q12769 1436 aa37.44■■■■□ 3.58
C20orf144-201ENST00000375222 CEP170Q5SW79 1584 aa37.4■■■■□ 3.58
C20orf144-201ENST00000375222 CUL7Q14999 1698 aa37.39■■■■□ 3.58
C20orf144-201ENST00000375222 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.34■■■■□ 3.57
C20orf144-201ENST00000375222 ARAP1Q96P48 1450 aa37.3■■■■□ 3.56
C20orf144-201ENST00000375222 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.26■■■■□ 3.55
C20orf144-201ENST00000375222 SHROOM2Q13796 1616 aa37.18■■■■□ 3.54
C20orf144-201ENST00000375222 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.15■■■■□ 3.54
C20orf144-201ENST00000375222 JPH4Q96JJ6 628 aa37.11■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms