RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617849.4

MED25-211, Transcript of mediator complex subunit 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MED25, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED25-211ENST00000617849 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.52■■■■■ 6.16
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MED25-211ENST00000617849 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
MED25-211ENST00000617849 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.32■■■■■ 4.68
MED25-211ENST00000617849 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.28■■■■■ 4.68
MED25-211ENST00000617849 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.1■■■■■ 4.65
MED25-211ENST00000617849 NACADO15069 1562 aa44.03■■■■■ 4.64
MED25-211ENST00000617849 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.83■■■■■ 4.61
MED25-211ENST00000617849 SCRIBQ14160 1630 aa43.11■■■■■ 4.49
MED25-211ENST00000617849 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.96■■■■■ 4.47
MED25-211ENST00000617849 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.87■■■■■ 4.45
MED25-211ENST00000617849 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.48■■■■■ 4.39
MED25-211ENST00000617849 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.36
MED25-211ENST00000617849 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.58■■■■■ 4.25
MED25-211ENST00000617849 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
MED25-211ENST00000617849 SMARCA4P51532 1647 aa41.31■■■■■ 4.2
MED25-211ENST00000617849 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.28■■■■■ 4.2
MED25-211ENST00000617849 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
MED25-211ENST00000617849 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.17■■■■■ 4.18
MED25-211ENST00000617849 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.94■■■■■ 4.14
MED25-211ENST00000617849 WIZO95785 1651 aa40.89■■■■■ 4.14
MED25-211ENST00000617849 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.87■■■■■ 4.13
MED25-211ENST00000617849 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.84■■■■■ 4.13
MED25-211ENST00000617849 SMARCA2P51531 1590 aa40.81■■■■■ 4.12
MED25-211ENST00000617849 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.81■■■■■ 4.12
MED25-211ENST00000617849 NCAPD3P42695 1498 aa40.61■■■■■ 4.09
MED25-211ENST00000617849 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
MED25-211ENST00000617849 HMGXB3Q12766 1538 aa40.53■■■■■ 4.08
MED25-211ENST00000617849 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
MED25-211ENST00000617849 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.41■■■■■ 4.06
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MED25-211ENST00000617849 CFTRP13569 1480 aa39.48■■■■□ 3.91
MED25-211ENST00000617849 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.38■■■■□ 3.89
MED25-211ENST00000617849 NESP48681 1621 aa39.34■■■■□ 3.89
MED25-211ENST00000617849 PRDM2Q13029 1718 aa39.3■■■■□ 3.88
MED25-211ENST00000617849 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.08■■■■□ 3.85
MED25-211ENST00000617849 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.05■■■■□ 3.84
MED25-211ENST00000617849 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.92■■■■□ 3.82
MED25-211ENST00000617849 ABCC8Q09428 1581 aa38.9■■■■□ 3.82
MED25-211ENST00000617849 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.9■■■■□ 3.82
MED25-211ENST00000617849 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.83■■■■□ 3.81
MED25-211ENST00000617849 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.79■■■■□ 3.8
MED25-211ENST00000617849 ERCC6Q03468 1493 aa38.78■■■■□ 3.8
MED25-211ENST00000617849 SYNJ1O43426 1573 aa38.67■■■■□ 3.78
MED25-211ENST00000617849 CUX1P39880 1505 aa38.66■■■■□ 3.78
MED25-211ENST00000617849 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.62■■■■□ 3.77
MED25-211ENST00000617849 TRIM41Q8WV44 630 aa38.61■■■■□ 3.77
MED25-211ENST00000617849 TOP2BQ02880 1626 aa38.61■■■■□ 3.77
MED25-211ENST00000617849 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
MED25-211ENST00000617849 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.6■■■■□ 3.77
MED25-211ENST00000617849 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.6■■■■□ 3.77
MED25-211ENST00000617849 TOPBP1Q92547 1522 aa38.55■■■■□ 3.76
MED25-211ENST00000617849 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
MED25-211ENST00000617849 WDR62O43379 1518 aa38.46■■■■□ 3.75
MED25-211ENST00000617849 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.36■■■■□ 3.73
MED25-211ENST00000617849 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
MED25-211ENST00000617849 SOGA1O94964 1423 aa38.14■■■■□ 3.7
MED25-211ENST00000617849 CUX2O14529 1486 aa38.12■■■■□ 3.69
MED25-211ENST00000617849 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.12■■■■□ 3.69
MED25-211ENST00000617849 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
MED25-211ENST00000617849 IFT140Q96RY7 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
MED25-211ENST00000617849 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.03■■■■□ 3.68
MED25-211ENST00000617849 WDR97A6NE52 1622 aa38■■■■□ 3.67
MED25-211ENST00000617849 KIF27Q86VH2 1401 aa37.9■■■■□ 3.66
MED25-211ENST00000617849 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.89■■■■□ 3.66
MED25-211ENST00000617849 EEA1Q15075 1411 aa37.88■■■■□ 3.65
MED25-211ENST00000617849 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
MED25-211ENST00000617849 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.8■■■■□ 3.64
MED25-211ENST00000617849 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
MED25-211ENST00000617849 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
MED25-211ENST00000617849 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.73■■■■□ 3.63
MED25-211ENST00000617849 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.7■■■■□ 3.637e-10■■■■■ 41.9
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MED25-211ENST00000617849 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.66■■■■□ 3.62
MED25-211ENST00000617849 IGF1RP08069 1367 aa37.61■■■■□ 3.61
MED25-211ENST00000617849 PBRM1Q86U86 1689 aa37.61■■■■□ 3.61
MED25-211ENST00000617849 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.59■■■■□ 3.61
MED25-211ENST00000617849 GRIN2BQ13224 1484 aa37.57■■■■□ 3.61
MED25-211ENST00000617849 CUL7Q14999 1698 aa37.47■■■■□ 3.59
MED25-211ENST00000617849 PRXQ9BXM0 1461 aa37.45■■■■□ 3.59
MED25-211ENST00000617849 KIF21BO75037 1637 aa37.42■■■■□ 3.58
MED25-211ENST00000617849 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.41■■■■□ 3.58
MED25-211ENST00000617849 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.4■■■■□ 3.58
MED25-211ENST00000617849 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
MED25-211ENST00000617849 ADAMTS12P58397 1594 aa37.37■■■■□ 3.57
MED25-211ENST00000617849 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.33■■■■□ 3.57
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MED25-211ENST00000617849 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.25■■■■□ 3.55
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MED25-211ENST00000617849 SYNJ2O15056 1496 aa37.2■■■■□ 3.55
MED25-211ENST00000617849 GRIN2AQ12879 1464 aa37.1■■■■□ 3.53
MED25-211ENST00000617849 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
MED25-211ENST00000617849 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
MED25-211ENST00000617849 FBLN2P98095 1184 aa37.04■■■■□ 3.52
MED25-211ENST00000617849 CHD1O14646 1710 aa37.02■■■■□ 3.52
MED25-211ENST00000617849 TNIKQ9UKE5 1360 aa37■■■■□ 3.51
MED25-211ENST00000617849 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.92■■■■□ 3.5
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