Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HOXA3O43365 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms