Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9Y3F1 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.122-201ENST00000610476 285 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q9Y3F1 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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