RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.41■■■□□ 2.62
TTC13-201ENST00000366661 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.74■■■□□ 2.03
TTC13-201ENST00000366661 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.67■■□□□ 1.86
TTC13-201ENST00000366661 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.46■■□□□ 1.83
TTC13-201ENST00000366661 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
TTC13-201ENST00000366661 ABCC9O60706 1549 aa26.27■■□□□ 1.8
TTC13-201ENST00000366661 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.14■■□□□ 1.77
TTC13-201ENST00000366661 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.02■■□□□ 1.76
TTC13-201ENST00000366661 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TTC13-201ENST00000366661 NACADO15069 1562 aa25.88■■□□□ 1.73
TTC13-201ENST00000366661 HRCP23327 699 aa25.84■■□□□ 1.73
TTC13-201ENST00000366661 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.72■■□□□ 1.71
TTC13-201ENST00000366661 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.71■■□□□ 1.71
TTC13-201ENST00000366661 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TTC13-201ENST00000366661 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TTC13-201ENST00000366661 SCRIBQ14160 1630 aa25.19■■□□□ 1.62
TTC13-201ENST00000366661 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.13■■□□□ 1.61
TTC13-201ENST00000366661 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
TTC13-201ENST00000366661 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.88■■□□□ 1.57
TTC13-201ENST00000366661 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
TTC13-201ENST00000366661 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.48■■□□□ 1.51
TTC13-201ENST00000366661 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC13-201ENST00000366661 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC13-201ENST00000366661 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
TTC13-201ENST00000366661 MYT1Q01538 1121 aa24.3■■□□□ 1.48
TTC13-201ENST00000366661 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
TTC13-201ENST00000366661 SMARCA4P51532 1647 aa24.24■■□□□ 1.47
TTC13-201ENST00000366661 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.23■■□□□ 1.47
TTC13-201ENST00000366661 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.22■■□□□ 1.47
TTC13-201ENST00000366661 NEUROD1Q13562 356 aa24.2■■□□□ 1.46
TTC13-201ENST00000366661 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TTC13-201ENST00000366661 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.16■■□□□ 1.46
TTC13-201ENST00000366661 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
TTC13-201ENST00000366661 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.07■■□□□ 1.44
TTC13-201ENST00000366661 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TTC13-201ENST00000366661 SMARCA2P51531 1590 aa23.98■■□□□ 1.43
TTC13-201ENST00000366661 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
TTC13-201ENST00000366661 WIZO95785 1651 aa23.94■■□□□ 1.42
TTC13-201ENST00000366661 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.91■■□□□ 1.42
TTC13-201ENST00000366661 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TTC13-201ENST00000366661 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.88■■□□□ 1.41
TTC13-201ENST00000366661 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TTC13-201ENST00000366661 NCAPD3P42695 1498 aa23.84■■□□□ 1.41
TTC13-201ENST00000366661 HMGXB3Q12766 1538 aa23.82■■□□□ 1.4
TTC13-201ENST00000366661 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TTC13-201ENST00000366661 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TTC13-201ENST00000366661 TRIM41Q8WV44 630 aa23.78■■□□□ 1.4
TTC13-201ENST00000366661 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
TTC13-201ENST00000366661 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
TTC13-201ENST00000366661 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TTC13-201ENST00000366661 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TTC13-201ENST00000366661 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TTC13-201ENST00000366661 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.45■■□□□ 1.34
TTC13-201ENST00000366661 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.43■■□□□ 1.34
TTC13-201ENST00000366661 BCL11AQ9H165 835 aa23.4■■□□□ 1.34
TTC13-201ENST00000366661 ABCC8Q09428 1581 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC13-201ENST00000366661 CFTRP13569 1480 aa23.17■■□□□ 1.3
TTC13-201ENST00000366661 PRDM2Q13029 1718 aa23.15■■□□□ 1.3
TTC13-201ENST00000366661 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.13■■□□□ 1.29
TTC13-201ENST00000366661 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.13■■□□□ 1.29
TTC13-201ENST00000366661 MIER1Q8N108 512 aa22.99■■□□□ 1.27
TTC13-201ENST00000366661 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.96■■□□□ 1.27
TTC13-201ENST00000366661 SOGA1O94964 1423 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 NESP48681 1621 aa22.93■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.92■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 BCANQ96GW7 911 aa22.89■■□□□ 1.26
TTC13-201ENST00000366661 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.87■■□□□ 1.25
TTC13-201ENST00000366661 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
TTC13-201ENST00000366661 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.86■■□□□ 1.25
TTC13-201ENST00000366661 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TTC13-201ENST00000366661 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.79■■□□□ 1.24
TTC13-201ENST00000366661 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.77■■□□□ 1.24
TTC13-201ENST00000366661 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TTC13-201ENST00000366661 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.7■■□□□ 1.23
TTC13-201ENST00000366661 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.7■■□□□ 1.22
TTC13-201ENST00000366661 SYNJ1O43426 1573 aa22.69■■□□□ 1.22
TTC13-201ENST00000366661 TOP2BQ02880 1626 aa22.69■■□□□ 1.22
TTC13-201ENST00000366661 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TTC13-201ENST00000366661 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.65■■□□□ 1.22
TTC13-201ENST00000366661 CUX1P39880 1505 aa22.64■■□□□ 1.22
TTC13-201ENST00000366661 ERCC6Q03468 1493 aa22.63■■□□□ 1.21
TTC13-201ENST00000366661 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.62■■□□□ 1.21
TTC13-201ENST00000366661 TOPBP1Q92547 1522 aa22.58■■□□□ 1.21
TTC13-201ENST00000366661 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
TTC13-201ENST00000366661 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
TTC13-201ENST00000366661 WDR62O43379 1518 aa22.56■■□□□ 1.2
TTC13-201ENST00000366661 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TTC13-201ENST00000366661 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.45■■□□□ 1.18
TTC13-201ENST00000366661 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TTC13-201ENST00000366661 CEP162Q5TB80 1403 aa22.42■■□□□ 1.18
TTC13-201ENST00000366661 ITGAEP38570 1179 aa22.4■■□□□ 1.18
TTC13-201ENST00000366661 EEA1Q15075 1411 aa22.38■■□□□ 1.17
TTC13-201ENST00000366661 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.35■■□□□ 1.17
TTC13-201ENST00000366661 GOLGA3Q08378 1498 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC13-201ENST00000366661 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.34■■□□□ 1.17
TTC13-201ENST00000366661 WDR97A6NE52 1622 aa22.33■■□□□ 1.17
TTC13-201ENST00000366661 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 278 ms