RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.55■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCC9O60706 1549 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.31■■□□□ 1.8
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NACADO15069 1562 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCRIBQ14160 1630 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMARCA4P51532 1647 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMARCA2P51531 1590 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.13■■□□□ 1.45
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WIZO95785 1651 aa24.08■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NCAPD3P42695 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HMGXB3Q12766 1538 aa24.05■■□□□ 1.44
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERCC6Q03468 1493 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CUX2O14529 1486 aa23.75■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NESP48681 1621 aa23.73■■□□□ 1.39
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-209ENST00000477144 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRDM2Q13029 1718 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CFTRP13569 1480 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WDR62O43379 1518 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.12■■□□□ 1.29
HOXB-AS3-209ENST00000477144 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRIM41Q8WV44 630 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.82■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCC8Q09428 1581 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CUX1P39880 1505 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOPBP1Q92547 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TOP2BQ02880 1626 aa22.75■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYNJ1O43426 1573 aa22.74■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
HOXB-AS3-209ENST00000477144 OSCARQ8IYS5 282 aa22.7■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IFT140Q96RY7 1462 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-209ENST00000477144 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
HOXB-AS3-209ENST00000477144 WDR97A6NE52 1622 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
HOXB-AS3-209ENST00000477144 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SOGA1O94964 1423 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHD1O14646 1710 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 EEA1Q15075 1411 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.39■■□□□ 1.18
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FBLN2P98095 1184 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARHGEF11O15085 1522 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PBRM1Q86U86 1689 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KIF27Q86VH2 1401 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GRIN2BQ13224 1484 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ADAMTS12P58397 1594 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CUL7Q14999 1698 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ARAP1Q96P48 1450 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SYNJ2O15056 1496 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGF1RP08069 1367 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 GOLGA3Q08378 1498 aa21.99■■□□□ 1.11
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