Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 SRSF10-216ENST00000497214 526 ntTSL 35.52□□□□□ -1.539e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ANKHD1-213ENST00000462121 782 ntTSL 34.87□□□□□ -1.639e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 USP8-218ENST00000561330 815 ntTSL 1 (best)3.95□□□□□ -1.789e-8■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-207ENST00000482549 1625 ntTSL 1 (best)23.44■■□□□ 1.348e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-204ENST00000469763 1642 ntTSL 523.19■■□□□ 1.38e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 RBM33-210ENST00000486747 559 ntTSL 316.85■□□□□ 0.298e-11■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PFDN4-203ENST00000474326 191 ntTSL 216.45■□□□□ 0.228e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 515.79■□□□□ 0.128e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.118e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.048e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.048e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-203ENST00000468316 2045 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.088e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.098e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.18e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.188e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-206ENST00000482465 2257 ntTSL 213.9□□□□□ -0.188e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.258e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-206ENST00000418133 622 ntTSL 513.11□□□□□ -0.318e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.318e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.48e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.448e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-207ENST00000422336 664 ntTSL 511.98□□□□□ -0.498e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 TMEM63A-203ENST00000474478 5407 ntTSL 211.97□□□□□ -0.498e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-212ENST00000634914 1431 ntTSL 511.74□□□□□ -0.538e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 511.72□□□□□ -0.538e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-219ENST00000541571 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.548e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.568e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.598e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 TMEM63A-205ENST00000483779 634 ntTSL 211.27□□□□□ -0.618e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.658e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-211ENST00000537613 894 ntTSL 211□□□□□ -0.658e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-222ENST00000545388 630 ntTSL 210.99□□□□□ -0.658e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-215ENST00000538850 1125 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.668e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-213ENST00000538565 1245 ntTSL 210.82□□□□□ -0.688e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-206ENST00000456820 2031 ntTSL 510.53□□□□□ -0.728e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-214ENST00000538709 491 ntTSL 210.38□□□□□ -0.758e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.758e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH8-211ENST00000635257 5602 ntTSL 510.22□□□□□ -0.778e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-207ENST00000534994 674 ntTSL 510.19□□□□□ -0.788e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.818e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.888e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.98e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 DDX10-201ENST00000322536 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.978e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.988e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 PRPF3-202ENST00000467329 2595 ntTSL 58.86□□□□□ -0.998e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)8.86□□□□□ -0.998e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.048e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.098e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-220ENST00000541918 908 ntTSL 58.16□□□□□ -1.18e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 28□□□□□ -1.138e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.148e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.188e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH11-203ENST00000473067 532 ntTSL 36.51□□□□□ -1.378e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ZC3H7A-206ENST00000571405 1930 ntTSL 26.47□□□□□ -1.378e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ZC3H7A-204ENST00000570918 1410 ntTSL 1 (best)6.36□□□□□ -1.398e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.448e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-210ENST00000537571 603 ntTSL 25.39□□□□□ -1.558e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.578e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.628e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 CSPP1-205ENST00000521168 1457 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.78e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.798e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.828e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 ICE1-203ENST00000512608 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.05□□□□□ -1.928e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 KRR1-205ENST00000551070 673 ntTSL 22.92□□□□□ -1.948e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.238e-6■■■□□ 18.8
TRA2AQ13595 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 212.38□□□□□ -0.432e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 212.35□□□□□ -0.432e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 511.17□□□□□ -0.622e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 511.02□□□□□ -0.642e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.722e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 29.97□□□□□ -0.812e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.842e-11■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 CWC25-204ENST00000619299 1894 ntTSL 211.4□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 CWC25-207ENST00000622665 976 ntTSL 310.83□□□□□ -0.681e-6■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 CWC25-206ENST00000619818 1127 ntTSL 210.52□□□□□ -0.731e-6■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 CWC25-202ENST00000614790 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-6■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 SUPT16H-207ENST00000557394 2324 ntTSL 29.63□□□□□ -0.873e-7■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.363e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.563e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.613e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.233e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.243e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.243e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.293e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.343e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.533e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.643e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-211ENST00000505625 7306 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.673e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 MATR3-202ENST00000502422 2250 ntTSL 1 (best)4.32□□□□□ -1.723e-14■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 SREK1-212ENST00000522912 2047 ntTSL 1 (best)15.42■□□□□ 0.063e-7■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.813e-6■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 CALM2-207ENST00000484408 682 ntTSL 519.92■□□□□ 0.782e-7■■■□□ 18.7
TRA2AQ13595 TAF7-203ENST00000624761 603 ntTSL 419.01■□□□□ 0.633e-7■■■□□ 18.6
TRA2AQ13595 PRC1-216ENST00000559828 584 ntTSL 39.49□□□□□ -0.892e-8■■■□□ 18.6
TRA2AQ13595 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.791e-6■■■□□ 18.6
TRA2AQ13595 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.593e-8■■■□□ 18.5
TRA2AQ13595 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-8■■■□□ 18.5
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 86.2 ms