RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486747.1

RBM33-210, Transcript of RNA binding motif protein 33, humanhuman

TSL 3

Gene RBM33, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM33-210ENST00000486747 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.8■■■■■ 4.28
RBM33-210ENST00000486747 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.24■■■■□ 3.55
RBM33-210ENST00000486747 ABCC9O60706 1549 aa37.03■■■■□ 3.52
RBM33-210ENST00000486747 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.38■■■■□ 3.25
RBM33-210ENST00000486747 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.36■■■■□ 3.25
RBM33-210ENST00000486747 NACADO15069 1562 aa35.23■■■■□ 3.23
RBM33-210ENST00000486747 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.87■■■■□ 3.17
RBM33-210ENST00000486747 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
RBM33-210ENST00000486747 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.63■■■■□ 3.13
RBM33-210ENST00000486747 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.54■■■■□ 3.12
RBM33-210ENST00000486747 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.46■■■■□ 3.11
RBM33-210ENST00000486747 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.35■■■■□ 3.09
RBM33-210ENST00000486747 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.24■■■■□ 3.07
RBM33-210ENST00000486747 SCRIBQ14160 1630 aa34■■■■□ 3.03
RBM33-210ENST00000486747 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.92■■■■□ 3.02
RBM33-210ENST00000486747 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
RBM33-210ENST00000486747 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.39■■■□□ 2.94
RBM33-210ENST00000486747 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.34■■■□□ 2.93
RBM33-210ENST00000486747 NCAPD3P42695 1498 aa32.57■■■□□ 2.8
RBM33-210ENST00000486747 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.49■■■□□ 2.79
RBM33-210ENST00000486747 SMARCA4P51532 1647 aa32.47■■■□□ 2.79
RBM33-210ENST00000486747 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
RBM33-210ENST00000486747 SMARCA2P51531 1590 aa32.41■■■□□ 2.78
RBM33-210ENST00000486747 HMGXB3Q12766 1538 aa32.27■■■□□ 2.76
RBM33-210ENST00000486747 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
RBM33-210ENST00000486747 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.19■■■□□ 2.74
RBM33-210ENST00000486747 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.15■■■□□ 2.74
RBM33-210ENST00000486747 ERCC6Q03468 1493 aa32■■■□□ 2.71
RBM33-210ENST00000486747 NESP48681 1621 aa31.87■■■□□ 2.69
RBM33-210ENST00000486747 CUX2O14529 1486 aa31.77■■■□□ 2.68
RBM33-210ENST00000486747 WIZO95785 1651 aa31.76■■■□□ 2.67
RBM33-210ENST00000486747 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
RBM33-210ENST00000486747 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.71■■■□□ 2.67
RBM33-210ENST00000486747 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.64■■■□□ 2.66
RBM33-210ENST00000486747 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.64■■■□□ 2.66
RBM33-210ENST00000486747 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.45■■■□□ 2.63
RBM33-210ENST00000486747 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
RBM33-210ENST00000486747 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
RBM33-210ENST00000486747 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.35■■■□□ 2.61
RBM33-210ENST00000486747 CFTRP13569 1480 aa31.3■■■□□ 2.6
RBM33-210ENST00000486747 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.26■■■□□ 2.59
RBM33-210ENST00000486747 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.22■■■□□ 2.59
RBM33-210ENST00000486747 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.21■■■□□ 2.59
RBM33-210ENST00000486747 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.14■■■□□ 2.58
RBM33-210ENST00000486747 WDR62O43379 1518 aa31.11■■■□□ 2.57
RBM33-210ENST00000486747 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
RBM33-210ENST00000486747 PRDM2Q13029 1718 aa30.78■■■□□ 2.52
RBM33-210ENST00000486747 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
RBM33-210ENST00000486747 ABCC8Q09428 1581 aa30.68■■■□□ 2.5
RBM33-210ENST00000486747 TOPBP1Q92547 1522 aa30.63■■■□□ 2.49
RBM33-210ENST00000486747 IFT140Q96RY7 1462 aa30.6■■■□□ 2.49
RBM33-210ENST00000486747 OSCARQ8IYS5 282 aa30.54■■■□□ 2.48
RBM33-210ENST00000486747 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.54■■■□□ 2.48
RBM33-210ENST00000486747 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
RBM33-210ENST00000486747 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
RBM33-210ENST00000486747 SOGA1O94964 1423 aa30.31■■■□□ 2.44
RBM33-210ENST00000486747 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.445e-11■□□□□ 10.2
RBM33-210ENST00000486747 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
RBM33-210ENST00000486747 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.25■■■□□ 2.43
RBM33-210ENST00000486747 TRIM41Q8WV44 630 aa30.24■■■□□ 2.43
RBM33-210ENST00000486747 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
RBM33-210ENST00000486747 CUX1P39880 1505 aa30.22■■■□□ 2.43
RBM33-210ENST00000486747 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.21■■■□□ 2.43
RBM33-210ENST00000486747 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
RBM33-210ENST00000486747 FBLN2P98095 1184 aa30.16■■■□□ 2.42
RBM33-210ENST00000486747 WDR97A6NE52 1622 aa30.02■■■□□ 2.4
RBM33-210ENST00000486747 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
RBM33-210ENST00000486747 GRIN2BQ13224 1484 aa29.97■■■□□ 2.39
RBM33-210ENST00000486747 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.94■■■□□ 2.38
RBM33-210ENST00000486747 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
RBM33-210ENST00000486747 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.92■■■□□ 2.38
RBM33-210ENST00000486747 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
RBM33-210ENST00000486747 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.9■■■□□ 2.38
RBM33-210ENST00000486747 CHD1O14646 1710 aa29.88■■■□□ 2.37
RBM33-210ENST00000486747 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
RBM33-210ENST00000486747 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
RBM33-210ENST00000486747 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.85■■■□□ 2.37
RBM33-210ENST00000486747 ARHGEF11O15085 1522 aa29.85■■■□□ 2.37
RBM33-210ENST00000486747 TOP2BQ02880 1626 aa29.82■■■□□ 2.36
RBM33-210ENST00000486747 SYNJ2O15056 1496 aa29.81■■■□□ 2.36
RBM33-210ENST00000486747 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.78■■■□□ 2.36
RBM33-210ENST00000486747 SYNJ1O43426 1573 aa29.77■■■□□ 2.36
RBM33-210ENST00000486747 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.76■■■□□ 2.35
RBM33-210ENST00000486747 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.72■■■□□ 2.35
RBM33-210ENST00000486747 PBRM1Q86U86 1689 aa29.68■■■□□ 2.34
RBM33-210ENST00000486747 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.63■■■□□ 2.33
RBM33-210ENST00000486747 ARAP1Q96P48 1450 aa29.57■■■□□ 2.32
RBM33-210ENST00000486747 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.56■■■□□ 2.32
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RBM33-210ENST00000486747 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.53■■■□□ 2.32
RBM33-210ENST00000486747 ADAMTS12P58397 1594 aa29.48■■■□□ 2.31
RBM33-210ENST00000486747 NUP160Q12769 1436 aa29.43■■■□□ 2.3
RBM33-210ENST00000486747 KIF27Q86VH2 1401 aa29.38■■■□□ 2.29
RBM33-210ENST00000486747 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
RBM33-210ENST00000486747 CEP170Q5SW79 1584 aa29.35■■■□□ 2.29
RBM33-210ENST00000486747 IGF1RP08069 1367 aa29.33■■■□□ 2.29
RBM33-210ENST00000486747 JPH4Q96JJ6 628 aa29.28■■■□□ 2.28
RBM33-210ENST00000486747 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
RBM33-210ENST00000486747 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.18■■■□□ 2.26
RBM33-210ENST00000486747 SHROOM2Q13796 1616 aa29.16■■■□□ 2.26
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