Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERFP50548 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERFP50548 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERFP50548 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERFP50548 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERFP50548 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERFP50548 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERFP50548 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERFP50548 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERFP50548 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERFP50548 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms