Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB2P49721 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB2P49721 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms