RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.11■■■■□ 3.37
GFI1-201ENST00000294702 HRCP23327 699 aa33.42■■■□□ 2.94
GFI1-201ENST00000294702 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
GFI1-201ENST00000294702 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
GFI1-201ENST00000294702 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.57■■■□□ 2.8
GFI1-201ENST00000294702 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.33■■■□□ 2.77
GFI1-201ENST00000294702 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.31■■■□□ 2.76
GFI1-201ENST00000294702 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.3■■■□□ 2.76
GFI1-201ENST00000294702 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.06■■■□□ 2.72
GFI1-201ENST00000294702 CHIC1Q5VXU3 224 aa32■■■□□ 2.71
GFI1-201ENST00000294702 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
GFI1-201ENST00000294702 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.61■■■□□ 2.65
GFI1-201ENST00000294702 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
GFI1-201ENST00000294702 MYT1Q01538 1121 aa31.35■■■□□ 2.61
GFI1-201ENST00000294702 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.32■■■□□ 2.6
GFI1-201ENST00000294702 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
GFI1-201ENST00000294702 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
GFI1-201ENST00000294702 NEUROD1Q13562 356 aa30.84■■■□□ 2.53
GFI1-201ENST00000294702 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
GFI1-201ENST00000294702 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.67■■■□□ 2.5
GFI1-201ENST00000294702 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
GFI1-201ENST00000294702 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
GFI1-201ENST00000294702 ABCC9O60706 1549 aa30.09■■■□□ 2.41
GFI1-201ENST00000294702 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
GFI1-201ENST00000294702 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.06■■■□□ 2.4
GFI1-201ENST00000294702 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
GFI1-201ENST00000294702 NACADO15069 1562 aa29.92■■■□□ 2.38
GFI1-201ENST00000294702 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
GFI1-201ENST00000294702 TRIM41Q8WV44 630 aa29.83■■■□□ 2.37
GFI1-201ENST00000294702 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.79■■■□□ 2.36
GFI1-201ENST00000294702 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.77■■■□□ 2.36
GFI1-201ENST00000294702 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
GFI1-201ENST00000294702 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
GFI1-201ENST00000294702 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
GFI1-201ENST00000294702 BCL11AQ9H165 835 aa29.46■■■□□ 2.31
GFI1-201ENST00000294702 MIER1Q8N108 512 aa29.44■■■□□ 2.3
GFI1-201ENST00000294702 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.28■■■□□ 2.28
GFI1-201ENST00000294702 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
GFI1-201ENST00000294702 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
GFI1-201ENST00000294702 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.12■■■□□ 2.25
GFI1-201ENST00000294702 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.03■■■□□ 2.24
GFI1-201ENST00000294702 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.96■■■□□ 2.23
GFI1-201ENST00000294702 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.92■■■□□ 2.22
GFI1-201ENST00000294702 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
GFI1-201ENST00000294702 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.72■■■□□ 2.19
GFI1-201ENST00000294702 CEP162Q5TB80 1403 aa28.66■■■□□ 2.18
GFI1-201ENST00000294702 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
GFI1-201ENST00000294702 SCRIBQ14160 1630 aa28.52■■■□□ 2.16
GFI1-201ENST00000294702 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.44■■■□□ 2.14
GFI1-201ENST00000294702 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
GFI1-201ENST00000294702 BCANQ96GW7 911 aa28.43■■■□□ 2.14
GFI1-201ENST00000294702 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
GFI1-201ENST00000294702 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.33■■■□□ 2.13
GFI1-201ENST00000294702 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.29■■■□□ 2.12
GFI1-201ENST00000294702 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.29■■■□□ 2.12
GFI1-201ENST00000294702 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
GFI1-201ENST00000294702 KCNH8Q96L42 1107 aa28.27■■■□□ 2.12
GFI1-201ENST00000294702 FKBP8Q14318 412 aa28.26■■■□□ 2.11
GFI1-201ENST00000294702 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
GFI1-201ENST00000294702 SOGA1O94964 1423 aa28.24■■■□□ 2.11
GFI1-201ENST00000294702 ABCC8Q09428 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
GFI1-201ENST00000294702 MSH5O43196 834 aa28.22■■■□□ 2.11
GFI1-201ENST00000294702 WIZO95785 1651 aa28.19■■■□□ 2.1
GFI1-201ENST00000294702 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.08■■■□□ 2.09
GFI1-201ENST00000294702 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
GFI1-201ENST00000294702 ITGAEP38570 1179 aa28.03■■■□□ 2.08
GFI1-201ENST00000294702 GOLGA3Q08378 1498 aa27.97■■■□□ 2.07
GFI1-201ENST00000294702 EEA1Q15075 1411 aa27.95■■■□□ 2.06
GFI1-201ENST00000294702 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
GFI1-201ENST00000294702 NEFLP07196 543 aa27.89■■■□□ 2.06
GFI1-201ENST00000294702 CLIP1P30622 1438 aa27.86■■■□□ 2.05
GFI1-201ENST00000294702 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.85■■■□□ 2.05
GFI1-201ENST00000294702 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.82■■■□□ 2.04
GFI1-201ENST00000294702 APLP2Q06481 763 aa27.81■■■□□ 2.04
GFI1-201ENST00000294702 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.79■■■□□ 2.04
GFI1-201ENST00000294702 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.75■■■□□ 2.03
GFI1-201ENST00000294702 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
GFI1-201ENST00000294702 TRIM52Q96A61 297 aa27.71■■■□□ 2.03
GFI1-201ENST00000294702 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
GFI1-201ENST00000294702 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.69■■■□□ 2.02
GFI1-201ENST00000294702 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
GFI1-201ENST00000294702 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.64■■■□□ 2.02
GFI1-201ENST00000294702 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.63■■■□□ 2.01
GFI1-201ENST00000294702 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.63■■■□□ 2.01
GFI1-201ENST00000294702 SMARCA4P51532 1647 aa27.57■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 SMARCA2P51531 1590 aa27.56■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 KIF21BO75037 1637 aa27.53■■■□□ 2
GFI1-201ENST00000294702 HMGXB3Q12766 1538 aa27.5■■□□□ 1.99
GFI1-201ENST00000294702 CCER2I3L3R5 266 aa27.48■■□□□ 1.99
GFI1-201ENST00000294702 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
GFI1-201ENST00000294702 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
GFI1-201ENST00000294702 NCAPD3P42695 1498 aa27.46■■□□□ 1.99
GFI1-201ENST00000294702 CUX2O14529 1486 aa27.43■■□□□ 1.98
GFI1-201ENST00000294702 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.41■■□□□ 1.98
GFI1-201ENST00000294702 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
GFI1-201ENST00000294702 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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