Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NINLQ9Y2I6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
NINLQ9Y2I6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NINLQ9Y2I6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NINLQ9Y2I6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NINLQ9Y2I6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NINLQ9Y2I6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NINLQ9Y2I6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
NINLQ9Y2I6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
NINLQ9Y2I6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NINLQ9Y2I6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
NINLQ9Y2I6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NINLQ9Y2I6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NINLQ9Y2I6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NINLQ9Y2I6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
NINLQ9Y2I6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NINLQ9Y2I6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NINLQ9Y2I6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NINLQ9Y2I6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NINLQ9Y2I6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NINLQ9Y2I6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NINLQ9Y2I6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
NINLQ9Y2I6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NINLQ9Y2I6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NINLQ9Y2I6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
NINLQ9Y2I6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NINLQ9Y2I6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NINLQ9Y2I6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
NINLQ9Y2I6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NINLQ9Y2I6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NINLQ9Y2I6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NINLQ9Y2I6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NINLQ9Y2I6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NINLQ9Y2I6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NINLQ9Y2I6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NINLQ9Y2I6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NINLQ9Y2I6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NINLQ9Y2I6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NINLQ9Y2I6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NINLQ9Y2I6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NINLQ9Y2I6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NINLQ9Y2I6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NINLQ9Y2I6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NINLQ9Y2I6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NINLQ9Y2I6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NINLQ9Y2I6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms