Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQV4

LAMP3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP3Q9UQV4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LAMP3Q9UQV4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LAMP3Q9UQV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LAMP3Q9UQV4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LAMP3Q9UQV4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMP3Q9UQV4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LAMP3Q9UQV4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMP3Q9UQV4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMP3Q9UQV4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMP3Q9UQV4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LAMP3Q9UQV4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LAMP3Q9UQV4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMP3Q9UQV4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMP3Q9UQV4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LAMP3Q9UQV4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms