Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBLCQ9ULV8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBLCQ9ULV8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBLCQ9ULV8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CBLCQ9ULV8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CBLCQ9ULV8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBLCQ9ULV8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBLCQ9ULV8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CBLCQ9ULV8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CBLCQ9ULV8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CBLCQ9ULV8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CBLCQ9ULV8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CBLCQ9ULV8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CBLCQ9ULV8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CBLCQ9ULV8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms