Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF490Q9ULM2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF490Q9ULM2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF490Q9ULM2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF490Q9ULM2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF490Q9ULM2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF490Q9ULM2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF490Q9ULM2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF490Q9ULM2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF490Q9ULM2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF490Q9ULM2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF490Q9ULM2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF490Q9ULM2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF490Q9ULM2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF490Q9ULM2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF490Q9ULM2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF490Q9ULM2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF490Q9ULM2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNF490Q9ULM2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF490Q9ULM2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF490Q9ULM2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF490Q9ULM2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms