Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SARDHQ9UL12 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SARDHQ9UL12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SARDHQ9UL12 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SARDHQ9UL12 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SARDHQ9UL12 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SARDHQ9UL12 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARDHQ9UL12 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARDHQ9UL12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARDHQ9UL12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SARDHQ9UL12 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SARDHQ9UL12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SARDHQ9UL12 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SARDHQ9UL12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SARDHQ9UL12 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SARDHQ9UL12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SARDHQ9UL12 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SARDHQ9UL12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SARDHQ9UL12 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SARDHQ9UL12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SARDHQ9UL12 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SARDHQ9UL12 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARDHQ9UL12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SARDHQ9UL12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARDHQ9UL12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARDHQ9UL12 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms