Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATPIF1Q9UII2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPIF1Q9UII2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATPIF1Q9UII2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPIF1Q9UII2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPIF1Q9UII2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATPIF1Q9UII2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATPIF1Q9UII2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATPIF1Q9UII2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATPIF1Q9UII2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPIF1Q9UII2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATPIF1Q9UII2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATPIF1Q9UII2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ATPIF1Q9UII2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATPIF1Q9UII2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATPIF1Q9UII2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATPIF1Q9UII2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms