Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 31.6
NOL12Q9UGY1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 31.6
NOL12Q9UGY1 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 314.83□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 31.5
NOL12Q9UGY1 SRRM2-210ENST00000572721 841 ntTSL 212.72□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 31.5
NOL12Q9UGY1 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.442e-13■■■■■ 31.5
NOL12Q9UGY1 SRRM2-211ENST00000572883 887 ntTSL 210.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 31.5
NOL12Q9UGY1 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.292e-13■■■■■ 31.5
NOL12Q9UGY1 TCIRG1-208ENST00000529364 868 ntTSL 314.81□□□□□ -0.048e-7■■■■■ 31
NOL12Q9UGY1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.636e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.76e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PDK1-205ENST00000431718 728 ntTSL 319.01■□□□□ 0.636e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-206ENST00000606952 1275 ntTSL 1 (best)16.91■□□□□ 0.36e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.36e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.176e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-205ENST00000497069 837 ntTSL 315.61■□□□□ 0.096e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 RECQL4-204ENST00000531875 988 ntTSL 515.38■□□□□ 0.056e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 RECQL4-201ENST00000301323 781 ntTSL 315.06■□□□□ 06e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 RECQL4-208ENST00000534626 1165 ntTSL 514.6□□□□□ -0.076e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.216e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PDK1-201ENST00000282077 14193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.266e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.496e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PMF1-204ENST00000466489 933 ntTSL 1 (best)10.78□□□□□ -0.686e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PDK1-208ENST00000443353 842 ntTSL 29.29□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PLCG1-213ENST00000599785 880 ntTSL 58.63□□□□□ -1.036e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 PDK1-206ENST00000436490 571 ntTSL 56.2□□□□□ -1.426e-9■■■■■ 30.1
NOL12Q9UGY1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-212ENST00000497001 1488 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-209ENST00000485044 1944 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 02e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-211ENST00000493535 1626 ntTSL 1 (best)14.98□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-208ENST00000468525 2727 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-203ENST00000411578 4683 ntTSL 513.94□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-213ENST00000612032 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 MST1R-202ENST00000344206 4198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 TMC6-215ENST00000590494 702 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 DPYSL2-201ENST00000311151 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 LAMP2-202ENST00000371335 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 29.8
NOL12Q9UGY1 ABCA7-206ENST00000525073 1918 ntTSL 223■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 29.3
NOL12Q9UGY1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.091e-6■■■■■ 29.3
NOL12Q9UGY1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 29.3
NOL12Q9UGY1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 29.3
NOL12Q9UGY1 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.54■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 29.3
NOL12Q9UGY1 ABCA7-212ENST00000530092 571 ntTSL 415.34■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 29.3
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 28.1
NOL12Q9UGY1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.123e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.873e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.623e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.573e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 USP36-210ENST00000588086 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PIEZO1-215ENST00000566414 564 ntTSL 415.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 MYO18A-213ENST00000532143 1002 ntTSL 315.37■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 MYO18A-207ENST00000530254 6479 ntTSL 1 (best)14.92□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 MYO18A-202ENST00000527372 9992 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.483e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 RNA5SP444-201ENST00000516844 106 ntBASIC9.74□□□□□ -0.853e-8■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.753e-79■■■■■ 27.9
NOL12Q9UGY1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.116e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 16e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 ERLIN1-201ENST00000370408 962 ntTSL 519.45■□□□□ 0.76e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.666e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-205ENST00000547095 5708 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.646e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.556e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.556e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 PCNX3-202ENST00000439247 3104 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.176e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SF3B2-209ENST00000530322 1163 ntTSL 515.88■□□□□ 0.136e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.116e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.046e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.16e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 PCNX3-205ENST00000531280 472 ntTSL 514.4□□□□□ -0.16e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.116e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SF3B2-214ENST00000533595 1081 ntTSL 514.21□□□□□ -0.136e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-214ENST00000641654 10382 ntBASIC12.31□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.446e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.526e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SF3B2-208ENST00000529994 1004 ntTSL 210.27□□□□□ -0.776e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 MON2-202ENST00000393630 13275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.846e-6■■■■■ 27.5
NOL12Q9UGY1 SERPINE1-201ENST00000223095 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 26.4 ms