RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370408.2

ERLIN1-201, Transcript of ER lipid raft associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene ERLIN1, Length 962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1-201ENST00000370408 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.04■■■■■ 6.24
ERLIN1-201ENST00000370408 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.21■■■■■ 5.31
ERLIN1-201ENST00000370408 ABCC9O60706 1549 aa48.15■■■■■ 5.3
ERLIN1-201ENST00000370408 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.85■■■■■ 4.93
ERLIN1-201ENST00000370408 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.66■■■■■ 4.9
ERLIN1-201ENST00000370408 NACADO15069 1562 aa45.62■■■■■ 4.89
ERLIN1-201ENST00000370408 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.08■■■■■ 4.81
ERLIN1-201ENST00000370408 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.05■■■■■ 4.8
ERLIN1-201ENST00000370408 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.98■■■■■ 4.79
ERLIN1-201ENST00000370408 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
ERLIN1-201ENST00000370408 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.7■■■■■ 4.75
ERLIN1-201ENST00000370408 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.6■■■■■ 4.73
ERLIN1-201ENST00000370408 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.54■■■■■ 4.72
ERLIN1-201ENST00000370408 SCRIBQ14160 1630 aa44.06■■■■■ 4.64
ERLIN1-201ENST00000370408 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.9■■■■■ 4.62
ERLIN1-201ENST00000370408 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.44■■■■■ 4.54
ERLIN1-201ENST00000370408 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
ERLIN1-201ENST00000370408 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.32■■■■■ 4.53
ERLIN1-201ENST00000370408 NCAPD3P42695 1498 aa42.18■■■■■ 4.34
ERLIN1-201ENST00000370408 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.1■■■■■ 4.33
ERLIN1-201ENST00000370408 SMARCA4P51532 1647 aa42.03■■■■■ 4.32
ERLIN1-201ENST00000370408 SMARCA2P51531 1590 aa41.92■■■■■ 4.3
ERLIN1-201ENST00000370408 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
ERLIN1-201ENST00000370408 HMGXB3Q12766 1538 aa41.8■■■■■ 4.28
ERLIN1-201ENST00000370408 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.67■■■■■ 4.26
ERLIN1-201ENST00000370408 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
ERLIN1-201ENST00000370408 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.62■■■■■ 4.25
ERLIN1-201ENST00000370408 ERCC6Q03468 1493 aa41.52■■■■■ 4.24
ERLIN1-201ENST00000370408 NESP48681 1621 aa41.44■■■■■ 4.22
ERLIN1-201ENST00000370408 CUX2O14529 1486 aa41.32■■■■■ 4.2
ERLIN1-201ENST00000370408 WIZO95785 1651 aa41.12■■■■■ 4.17
ERLIN1-201ENST00000370408 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.11■■■■■ 4.17
ERLIN1-201ENST00000370408 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.1■■■■■ 4.17
ERLIN1-201ENST00000370408 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.95■■■■■ 4.15
ERLIN1-201ENST00000370408 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
ERLIN1-201ENST00000370408 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.94■■■■■ 4.14
ERLIN1-201ENST00000370408 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.77■■■■■ 4.12
ERLIN1-201ENST00000370408 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
ERLIN1-201ENST00000370408 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.54■■■■■ 4.08
ERLIN1-201ENST00000370408 CFTRP13569 1480 aa40.5■■■■■ 4.07
ERLIN1-201ENST00000370408 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.44■■■■■ 4.06
ERLIN1-201ENST00000370408 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.43■■■■■ 4.06
ERLIN1-201ENST00000370408 WDR62O43379 1518 aa40.39■■■■■ 4.06
ERLIN1-201ENST00000370408 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.25■■■■■ 4.03
ERLIN1-201ENST00000370408 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
ERLIN1-201ENST00000370408 PRDM2Q13029 1718 aa39.88■■■■□ 3.97
ERLIN1-201ENST00000370408 TOPBP1Q92547 1522 aa39.69■■■■□ 3.94
ERLIN1-201ENST00000370408 IFT140Q96RY7 1462 aa39.62■■■■□ 3.93
ERLIN1-201ENST00000370408 ABCC8Q09428 1581 aa39.61■■■■□ 3.93
ERLIN1-201ENST00000370408 OSCARQ8IYS5 282 aa39.61■■■■□ 3.93
ERLIN1-201ENST00000370408 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
ERLIN1-201ENST00000370408 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.52■■■■□ 3.92
ERLIN1-201ENST00000370408 TRIM41Q8WV44 630 aa39.45■■■■□ 3.91
ERLIN1-201ENST00000370408 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
ERLIN1-201ENST00000370408 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
ERLIN1-201ENST00000370408 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.888e-7■■■■□ 23.9
ERLIN1-201ENST00000370408 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
ERLIN1-201ENST00000370408 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
ERLIN1-201ENST00000370408 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.21■■■■□ 3.87
ERLIN1-201ENST00000370408 SOGA1O94964 1423 aa39.19■■■■□ 3.86
ERLIN1-201ENST00000370408 CUX1P39880 1505 aa39.12■■■■□ 3.85
ERLIN1-201ENST00000370408 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
ERLIN1-201ENST00000370408 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.11■■■■□ 3.85
ERLIN1-201ENST00000370408 FBLN2P98095 1184 aa39.02■■■■□ 3.84
ERLIN1-201ENST00000370408 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
ERLIN1-201ENST00000370408 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
ERLIN1-201ENST00000370408 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
ERLIN1-201ENST00000370408 CHD1O14646 1710 aa38.86■■■■□ 3.81
ERLIN1-201ENST00000370408 ARHGEF11O15085 1522 aa38.85■■■■□ 3.81
ERLIN1-201ENST00000370408 WDR97A6NE52 1622 aa38.83■■■■□ 3.81
ERLIN1-201ENST00000370408 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.83■■■■□ 3.81
ERLIN1-201ENST00000370408 GRIN2BQ13224 1484 aa38.77■■■■□ 3.8
ERLIN1-201ENST00000370408 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
ERLIN1-201ENST00000370408 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
ERLIN1-201ENST00000370408 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.69■■■■□ 3.78
ERLIN1-201ENST00000370408 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.68■■■■□ 3.78
ERLIN1-201ENST00000370408 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.67■■■■□ 3.78
ERLIN1-201ENST00000370408 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.6■■■■□ 3.77
ERLIN1-201ENST00000370408 SYNJ2O15056 1496 aa38.6■■■■□ 3.77
ERLIN1-201ENST00000370408 ARAP1Q96P48 1450 aa38.52■■■■□ 3.76
ERLIN1-201ENST00000370408 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.52■■■■□ 3.76
ERLIN1-201ENST00000370408 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.51■■■■□ 3.76
ERLIN1-201ENST00000370408 TOP2BQ02880 1626 aa38.5■■■■□ 3.75
ERLIN1-201ENST00000370408 SYNJ1O43426 1573 aa38.49■■■■□ 3.75
ERLIN1-201ENST00000370408 PBRM1Q86U86 1689 aa38.49■■■■□ 3.75
ERLIN1-201ENST00000370408 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.47■■■■□ 3.75
ERLIN1-201ENST00000370408 GRIN2AQ12879 1464 aa38.26■■■■□ 3.72
ERLIN1-201ENST00000370408 ADAMTS12P58397 1594 aa38.22■■■■□ 3.71
ERLIN1-201ENST00000370408 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.21■■■■□ 3.71
ERLIN1-201ENST00000370408 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
ERLIN1-201ENST00000370408 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.16■■■■□ 3.7
ERLIN1-201ENST00000370408 NUP160Q12769 1436 aa38.14■■■■□ 3.7
ERLIN1-201ENST00000370408 CEP170Q5SW79 1584 aa38.08■■■■□ 3.69
ERLIN1-201ENST00000370408 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.98■■■■□ 3.67
ERLIN1-201ENST00000370408 IGF1RP08069 1367 aa37.87■■■■□ 3.65
ERLIN1-201ENST00000370408 JPH4Q96JJ6 628 aa37.85■■■■□ 3.65
ERLIN1-201ENST00000370408 SHROOM2Q13796 1616 aa37.85■■■■□ 3.65
ERLIN1-201ENST00000370408 KIF27Q86VH2 1401 aa37.85■■■■□ 3.65
ERLIN1-201ENST00000370408 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms