Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWV4

C1orf123, UPF0587 protein C1orf123, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf123Q9NWV4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1orf123Q9NWV4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1orf123Q9NWV4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1orf123Q9NWV4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf123Q9NWV4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1orf123Q9NWV4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf123Q9NWV4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1orf123Q9NWV4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1orf123Q9NWV4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf123Q9NWV4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1orf123Q9NWV4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1orf123Q9NWV4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf123Q9NWV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf123Q9NWV4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf123Q9NWV4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf123Q9NWV4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms