Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COG4Q9H9E3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COG4Q9H9E3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COG4Q9H9E3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COG4Q9H9E3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG4Q9H9E3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG4Q9H9E3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COG4Q9H9E3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG4Q9H9E3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
COG4Q9H9E3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG4Q9H9E3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms