Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEMA6CQ9H3T2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA6CQ9H3T2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA6CQ9H3T2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA6CQ9H3T2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA6CQ9H3T2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SEMA6CQ9H3T2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6CQ9H3T2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6CQ9H3T2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA6CQ9H3T2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA6CQ9H3T2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA6CQ9H3T2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA6CQ9H3T2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA6CQ9H3T2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6CQ9H3T2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6CQ9H3T2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA6CQ9H3T2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6CQ9H3T2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA6CQ9H3T2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA6CQ9H3T2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEMA6CQ9H3T2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA6CQ9H3T2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEMA6CQ9H3T2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SEMA6CQ9H3T2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA6CQ9H3T2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms