Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NSD3Q9BZ95 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NSD3Q9BZ95 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NSD3Q9BZ95 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
NSD3Q9BZ95 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NSD3Q9BZ95 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NSD3Q9BZ95 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NSD3Q9BZ95 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NSD3Q9BZ95 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NSD3Q9BZ95 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NSD3Q9BZ95 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NSD3Q9BZ95 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
NSD3Q9BZ95 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NSD3Q9BZ95 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NSD3Q9BZ95 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NSD3Q9BZ95 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
NSD3Q9BZ95 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NSD3Q9BZ95 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NSD3Q9BZ95 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NSD3Q9BZ95 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NSD3Q9BZ95 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NSD3Q9BZ95 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NSD3Q9BZ95 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NSD3Q9BZ95 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NSD3Q9BZ95 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NSD3Q9BZ95 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NSD3Q9BZ95 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NSD3Q9BZ95 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
NSD3Q9BZ95 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
NSD3Q9BZ95 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NSD3Q9BZ95 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NSD3Q9BZ95 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NSD3Q9BZ95 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NSD3Q9BZ95 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NSD3Q9BZ95 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NSD3Q9BZ95 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NSD3Q9BZ95 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NSD3Q9BZ95 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NSD3Q9BZ95 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NSD3Q9BZ95 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
NSD3Q9BZ95 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NSD3Q9BZ95 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NSD3Q9BZ95 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NSD3Q9BZ95 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NSD3Q9BZ95 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NSD3Q9BZ95 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NSD3Q9BZ95 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms