Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C1QTNF6Q9BXI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C1QTNF6Q9BXI9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C1QTNF6Q9BXI9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF6Q9BXI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C1QTNF6Q9BXI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C1QTNF6Q9BXI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C1QTNF6Q9BXI9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF6Q9BXI9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF6Q9BXI9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1QTNF6Q9BXI9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C1QTNF6Q9BXI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1QTNF6Q9BXI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1QTNF6Q9BXI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1QTNF6Q9BXI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms