Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXI9

C1QTNF6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF6Q9BXI9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
C1QTNF6Q9BXI9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C1QTNF6Q9BXI9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1QTNF6Q9BXI9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C1QTNF6Q9BXI9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C1QTNF6Q9BXI9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C1QTNF6Q9BXI9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
C1QTNF6Q9BXI9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
C1QTNF6Q9BXI9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QTNF6Q9BXI9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1QTNF6Q9BXI9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C1QTNF6Q9BXI9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C1QTNF6Q9BXI9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1QTNF6Q9BXI9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1QTNF6Q9BXI9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1QTNF6Q9BXI9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1QTNF6Q9BXI9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1QTNF6Q9BXI9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1QTNF6Q9BXI9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1QTNF6Q9BXI9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1QTNF6Q9BXI9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1QTNF6Q9BXI9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C1QTNF6Q9BXI9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
C1QTNF6Q9BXI9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
C1QTNF6Q9BXI9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
C1QTNF6Q9BXI9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
C1QTNF6Q9BXI9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
C1QTNF6Q9BXI9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1QTNF6Q9BXI9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1QTNF6Q9BXI9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1QTNF6Q9BXI9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1QTNF6Q9BXI9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1QTNF6Q9BXI9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1QTNF6Q9BXI9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C1QTNF6Q9BXI9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C1QTNF6Q9BXI9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C1QTNF6Q9BXI9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C1QTNF6Q9BXI9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C1QTNF6Q9BXI9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1QTNF6Q9BXI9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C1QTNF6Q9BXI9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF6Q9BXI9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C1QTNF6Q9BXI9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C1QTNF6Q9BXI9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
C1QTNF6Q9BXI9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QTNF6Q9BXI9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C1QTNF6Q9BXI9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF6Q9BXI9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF6Q9BXI9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF6Q9BXI9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF6Q9BXI9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF6Q9BXI9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C1QTNF6Q9BXI9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C1QTNF6Q9BXI9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C1QTNF6Q9BXI9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
C1QTNF6Q9BXI9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1QTNF6Q9BXI9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1QTNF6Q9BXI9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1QTNF6Q9BXI9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1QTNF6Q9BXI9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1QTNF6Q9BXI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1QTNF6Q9BXI9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1QTNF6Q9BXI9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1QTNF6Q9BXI9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C1QTNF6Q9BXI9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1QTNF6Q9BXI9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1QTNF6Q9BXI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C1QTNF6Q9BXI9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1QTNF6Q9BXI9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1QTNF6Q9BXI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1QTNF6Q9BXI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C1QTNF6Q9BXI9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C1QTNF6Q9BXI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C1QTNF6Q9BXI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
C1QTNF6Q9BXI9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
C1QTNF6Q9BXI9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C1QTNF6Q9BXI9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C1QTNF6Q9BXI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C1QTNF6Q9BXI9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C1QTNF6Q9BXI9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C1QTNF6Q9BXI9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C1QTNF6Q9BXI9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C1QTNF6Q9BXI9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C1QTNF6Q9BXI9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C1QTNF6Q9BXI9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C1QTNF6Q9BXI9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C1QTNF6Q9BXI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF6Q9BXI9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C1QTNF6Q9BXI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
C1QTNF6Q9BXI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
C1QTNF6Q9BXI9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF6Q9BXI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C1QTNF6Q9BXI9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C1QTNF6Q9BXI9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms