Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN3Q9BWM7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN3Q9BWM7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN3Q9BWM7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN3Q9BWM7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN3Q9BWM7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN3Q9BWM7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN3Q9BWM7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN3Q9BWM7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFXN3Q9BWM7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN3Q9BWM7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN3Q9BWM7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFXN3Q9BWM7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFXN3Q9BWM7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFXN3Q9BWM7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFXN3Q9BWM7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFXN3Q9BWM7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFXN3Q9BWM7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN3Q9BWM7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SFXN3Q9BWM7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFXN3Q9BWM7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFXN3Q9BWM7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFXN3Q9BWM7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFXN3Q9BWM7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFXN3Q9BWM7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFXN3Q9BWM7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN3Q9BWM7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFXN3Q9BWM7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFXN3Q9BWM7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFXN3Q9BWM7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFXN3Q9BWM7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFXN3Q9BWM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms