Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SFXN3Q9BWM7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SFXN3Q9BWM7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SFXN3Q9BWM7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SFXN3Q9BWM7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SFXN3Q9BWM7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SFXN3Q9BWM7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SFXN3Q9BWM7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SFXN3Q9BWM7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SFXN3Q9BWM7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SFXN3Q9BWM7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SFXN3Q9BWM7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SFXN3Q9BWM7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SFXN3Q9BWM7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SFXN3Q9BWM7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SFXN3Q9BWM7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SFXN3Q9BWM7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SFXN3Q9BWM7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SFXN3Q9BWM7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SFXN3Q9BWM7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SFXN3Q9BWM7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SFXN3Q9BWM7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SFXN3Q9BWM7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFXN3Q9BWM7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFXN3Q9BWM7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFXN3Q9BWM7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFXN3Q9BWM7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFXN3Q9BWM7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFXN3Q9BWM7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFXN3Q9BWM7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFXN3Q9BWM7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFXN3Q9BWM7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFXN3Q9BWM7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFXN3Q9BWM7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SFXN3Q9BWM7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SFXN3Q9BWM7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFXN3Q9BWM7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SFXN3Q9BWM7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SFXN3Q9BWM7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SFXN3Q9BWM7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SFXN3Q9BWM7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFXN3Q9BWM7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SFXN3Q9BWM7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SFXN3Q9BWM7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SFXN3Q9BWM7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SFXN3Q9BWM7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SFXN3Q9BWM7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFXN3Q9BWM7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFXN3Q9BWM7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SFXN3Q9BWM7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SFXN3Q9BWM7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SFXN3Q9BWM7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SFXN3Q9BWM7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFXN3Q9BWM7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFXN3Q9BWM7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFXN3Q9BWM7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFXN3Q9BWM7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFXN3Q9BWM7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFXN3Q9BWM7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SFXN3Q9BWM7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SFXN3Q9BWM7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SFXN3Q9BWM7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SFXN3Q9BWM7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SFXN3Q9BWM7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SFXN3Q9BWM7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SFXN3Q9BWM7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFXN3Q9BWM7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SFXN3Q9BWM7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SFXN3Q9BWM7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SFXN3Q9BWM7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SFXN3Q9BWM7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SFXN3Q9BWM7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SFXN3Q9BWM7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SFXN3Q9BWM7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SFXN3Q9BWM7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFXN3Q9BWM7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFXN3Q9BWM7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFXN3Q9BWM7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFXN3Q9BWM7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFXN3Q9BWM7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFXN3Q9BWM7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFXN3Q9BWM7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFXN3Q9BWM7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFXN3Q9BWM7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SFXN3Q9BWM7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFXN3Q9BWM7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SFXN3Q9BWM7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SFXN3Q9BWM7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SFXN3Q9BWM7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SFXN3Q9BWM7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFXN3Q9BWM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SFXN3Q9BWM7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SFXN3Q9BWM7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms