Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPPD1Q9BV87 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPPD1Q9BV87 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPPD1Q9BV87 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPPD1Q9BV87 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPPD1Q9BV87 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPPD1Q9BV87 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPPD1Q9BV87 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPPD1Q9BV87 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNPPD1Q9BV87 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNPPD1Q9BV87 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNPPD1Q9BV87 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNPPD1Q9BV87 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNPPD1Q9BV87 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNPPD1Q9BV87 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CNPPD1Q9BV87 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNPPD1Q9BV87 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms