Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UPK3BQ9BT76 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UPK3BQ9BT76 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPK3BQ9BT76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
UPK3BQ9BT76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UPK3BQ9BT76 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UPK3BQ9BT76 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UPK3BQ9BT76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms