Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BQ9BT76 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPK3BQ9BT76 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPK3BQ9BT76 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPK3BQ9BT76 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UPK3BQ9BT76 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UPK3BQ9BT76 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UPK3BQ9BT76 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UPK3BQ9BT76 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPK3BQ9BT76 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPK3BQ9BT76 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UPK3BQ9BT76 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BQ9BT76 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UPK3BQ9BT76 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UPK3BQ9BT76 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPK3BQ9BT76 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPK3BQ9BT76 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BQ9BT76 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPK3BQ9BT76 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UPK3BQ9BT76 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UPK3BQ9BT76 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UPK3BQ9BT76 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UPK3BQ9BT76 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPK3BQ9BT76 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPK3BQ9BT76 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPK3BQ9BT76 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
UPK3BQ9BT76 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UPK3BQ9BT76 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UPK3BQ9BT76 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BQ9BT76 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UPK3BQ9BT76 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UPK3BQ9BT76 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UPK3BQ9BT76 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UPK3BQ9BT76 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UPK3BQ9BT76 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UPK3BQ9BT76 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UPK3BQ9BT76 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BQ9BT76 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
UPK3BQ9BT76 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
UPK3BQ9BT76 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
UPK3BQ9BT76 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
UPK3BQ9BT76 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UPK3BQ9BT76 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UPK3BQ9BT76 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BQ9BT76 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UPK3BQ9BT76 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UPK3BQ9BT76 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UPK3BQ9BT76 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
UPK3BQ9BT76 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
UPK3BQ9BT76 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
UPK3BQ9BT76 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
UPK3BQ9BT76 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
UPK3BQ9BT76 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UPK3BQ9BT76 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UPK3BQ9BT76 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UPK3BQ9BT76 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UPK3BQ9BT76 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UPK3BQ9BT76 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UPK3BQ9BT76 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BQ9BT76 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UPK3BQ9BT76 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UPK3BQ9BT76 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UPK3BQ9BT76 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UPK3BQ9BT76 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UPK3BQ9BT76 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
UPK3BQ9BT76 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UPK3BQ9BT76 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UPK3BQ9BT76 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UPK3BQ9BT76 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UPK3BQ9BT76 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UPK3BQ9BT76 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UPK3BQ9BT76 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPK3BQ9BT76 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UPK3BQ9BT76 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UPK3BQ9BT76 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UPK3BQ9BT76 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UPK3BQ9BT76 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UPK3BQ9BT76 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UPK3BQ9BT76 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UPK3BQ9BT76 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UPK3BQ9BT76 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UPK3BQ9BT76 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPK3BQ9BT76 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPK3BQ9BT76 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPK3BQ9BT76 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPK3BQ9BT76 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPK3BQ9BT76 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UPK3BQ9BT76 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UPK3BQ9BT76 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UPK3BQ9BT76 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BQ9BT76 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UPK3BQ9BT76 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UPK3BQ9BT76 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BQ9BT76 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms