Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK4

BBS4, Bardet-Biedl syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS4Q96RK4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BBS4Q96RK4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BBS4Q96RK4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BBS4Q96RK4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BBS4Q96RK4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BBS4Q96RK4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BBS4Q96RK4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BBS4Q96RK4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BBS4Q96RK4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BBS4Q96RK4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS4Q96RK4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS4Q96RK4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS4Q96RK4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBS4Q96RK4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBS4Q96RK4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBS4Q96RK4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS4Q96RK4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS4Q96RK4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms