Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC138Q96M89 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC138Q96M89 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC138Q96M89 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC138Q96M89 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC138Q96M89 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC138Q96M89 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC138Q96M89 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC138Q96M89 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC138Q96M89 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC138Q96M89 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC138Q96M89 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC138Q96M89 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC138Q96M89 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms