Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FRAT1Q92837 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FRAT1Q92837 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FRAT1Q92837 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
FRAT1Q92837 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
FRAT1Q92837 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRAT1Q92837 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRAT1Q92837 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FRAT1Q92837 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRAT1Q92837 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRAT1Q92837 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRAT1Q92837 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FRAT1Q92837 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
FRAT1Q92837 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FRAT1Q92837 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
FRAT1Q92837 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FRAT1Q92837 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRAT1Q92837 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FRAT1Q92837 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRAT1Q92837 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRAT1Q92837 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FRAT1Q92837 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
FRAT1Q92837 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
FRAT1Q92837 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
FRAT1Q92837 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
FRAT1Q92837 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms