Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM171Q8WVE6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM171Q8WVE6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM171Q8WVE6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM171Q8WVE6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM171Q8WVE6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM171Q8WVE6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM171Q8WVE6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM171Q8WVE6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM171Q8WVE6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TMEM171Q8WVE6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM171Q8WVE6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM171Q8WVE6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM171Q8WVE6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM171Q8WVE6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms