Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DTX3LQ8TDB6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DTX3LQ8TDB6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DTX3LQ8TDB6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DTX3LQ8TDB6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DTX3LQ8TDB6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DTX3LQ8TDB6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DTX3LQ8TDB6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DTX3LQ8TDB6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DTX3LQ8TDB6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DTX3LQ8TDB6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DTX3LQ8TDB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DTX3LQ8TDB6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DTX3LQ8TDB6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DTX3LQ8TDB6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DTX3LQ8TDB6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DTX3LQ8TDB6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DTX3LQ8TDB6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DTX3LQ8TDB6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DTX3LQ8TDB6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DTX3LQ8TDB6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DTX3LQ8TDB6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms