Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF439Q8NDP4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF439Q8NDP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF439Q8NDP4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF439Q8NDP4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF439Q8NDP4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF439Q8NDP4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF439Q8NDP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF439Q8NDP4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF439Q8NDP4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF439Q8NDP4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF439Q8NDP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF439Q8NDP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF439Q8NDP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms