Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM99Q8N816 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM99Q8N816 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM99Q8N816 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM99Q8N816 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM99Q8N816 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM99Q8N816 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM99Q8N816 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM99Q8N816 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM99Q8N816 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM99Q8N816 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM99Q8N816 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM99Q8N816 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM99Q8N816 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms