Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
UBR7Q8N806 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
UBR7Q8N806 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
UBR7Q8N806 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
UBR7Q8N806 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
UBR7Q8N806 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
UBR7Q8N806 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR7Q8N806 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
UBR7Q8N806 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBR7Q8N806 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR7Q8N806 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBR7Q8N806 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
UBR7Q8N806 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR7Q8N806 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR7Q8N806 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
UBR7Q8N806 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
UBR7Q8N806 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
UBR7Q8N806 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
UBR7Q8N806 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBR7Q8N806 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR7Q8N806 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
UBR7Q8N806 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
UBR7Q8N806 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBR7Q8N806 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBR7Q8N806 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
UBR7Q8N806 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
UBR7Q8N806 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UBR7Q8N806 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBR7Q8N806 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.6 ms